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π-π堆积的距离怎么测量?
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eightful0410
金虫
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专业: 合成药物化学
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π-π堆积的距离怎么测量?
π-π堆积的距离怎么测量?谢了
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1楼
2008-04-27 21:23:16
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wzyou2008
木虫
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注册: 2008-04-26
性别: GG
专业: 有机合成
在DIAMOND里面可以自己量。
首先按住SHIFT键,然后单击选中芳香环上的各个原子,然后依次打开工具栏中的structure--insert atom,此时你会发现芳香环的中心出现一个黑色原子,恭喜!你找到此环的中心了。同样方式找到相邻芳香环的中心,然后用测距离工具,测一下两个环中心的距离。如果距离在3.8埃左右,则存在π-π堆积
;反之,不存在。
如果你熟悉XP中的命令,那里面也有类似的命令来操作。不过不如DIAMOND操作方便简单。
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随遇而安!
7楼
2008-04-29 13:33:28
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lijianghua2007
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注册: 2007-05-09
性别: GG
专业: 原子簇化学
管辖:
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π-π堆积
这是一种常常发生在芳香环之间的弱的相互作用,通常存在于相对复电子和缺电子的两个分子之间。
常见的堆叠方式有两种:面对面和面对边。
面对边相互作用可以看作是一个芳环上轻微缺电子的氢原子和另一个芳环上复电子的π电子云之间形成的弱氢键.
要是单晶就可以用X衍射仪测出来了.
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淡泊名利,宁静致远。
2楼
2008-04-27 22:49:40
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sunyunti
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虫号: 390577
注册: 2007-06-02
专业: 有机分子功能材料化学
请问二楼的一些问题:有关堆积数据是在哪个文件里,lst还是cif?在XP里画堆积图时的那个命令是什么?
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快乐的阳光
4楼
2008-04-28 14:42:55
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hqzhang
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专业: 催化化学
PLATON可以计算的吧
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5楼
2008-04-28 15:46:32
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