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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 重组表达之前交给优化密码子，但不明白优化的细节，详情请看帖
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

[求助] 重组表达之前交给优化密码子，但不明白优化的细节，详情请看帖

有一个基因是之前被密码子优化希望在毕赤酵母中表达的，是公司优化的，但我对密码子优化的细节不明白。举个例子，这个原始基因之中有20个T，但是在被优化之后只有18个的密码子改变为毕赤酵母中氨基酸T最常用的密码子，剩余2个在原始基因中并非是毕赤酵母中最常用的密码子的，却保留下来并未优化，为什么留了2个？是否是规避引入某些酶切位点？详细的序列和比对图请看附件里的PPT，我想尽快知道原因，请各位解释PPT里的疑问。每个我标记出来为“AA某”的氨基酸算一个疑问并价值8个金币，原则上对于某个疑问，如果没有更好的解释，则第一个解释该疑问的ID获得8个金币。为了方便对照，我将优化为最优密码子的密码子和氨基酸处用红色粗线条方框来标记出来了。来吧，请解答！
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  • 附件 1 : 密码子优化疑问.ppt
    • 2014-10-03 00:32:11, 608 K

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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
1楼 2014-10-03 00:33:32
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
这个密码子优化是公司通过程序来做的，我已经联系了公司，公司不告知我详情。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼2014-12-04 13:20:50
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jjwhl

银虫 (正式写手)
楼主 ，请问你那有没有通过密码子优化来提高毕赤酵母中表达量的文献啊，方便的话 给个链接。我用毕赤酵母表达的酶蛋白表达量很低，打算通过密码子优化来提高其酶活，可行吗
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3楼2015-01-06 13:01:23
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
引用回帖:
3楼: Originally posted by jjwhl at 2015-01-06 13:01:23
楼主 ，请问你那有没有通过密码子优化来提高毕赤酵母中表达量的文献啊，方便的话 给个链接。我用毕赤酵母表达的酶蛋白表达量很低，打算通过密码子优化来提高其酶活，可行吗

http://scholar.google.com/schola ... &as_sdtp=on
这是别人给我的网页，我觉得有用
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2015-01-06 19:38:38
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