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卡卡罗特zxg

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by liuderong at 2014-10-11 17:18:50
用本地blast是要下载所有链霉菌的蛋白序列的,NCBI里好像没有单独将链霉菌的蛋白整理出来,你可以下载所有细菌的蛋白,ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/bacteria/这个FTP里头,进去之后网页拉到下面一点 ...

我想问一下,我目的是为了找出20种物种的共有基因,将20种物种基因建立数据库,然后自己与自己比对,得到的结果是:每个基因与其匹配的基因数及序列,我该如何进一步分析得出共有基因?
11楼2016-10-17 09:19:27
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 卡卡罗特zxg at 2016-10-17 09:19:27
我想问一下,我目的是为了找出20种物种的共有基因,将20种物种基因建立数据库,然后自己与自己比对,得到的结果是:每个基因与其匹配的基因数及序列,我该如何进一步分析得出共有基因?...

个人的一些建议,不一定对,你最好是找到类似的文献,然后根据文献方法来找。
比如A、B、C三个物种,如果我做的话,我会先找A、B物种的共有基因,然后再用A、B共有的基因调C物种的基因。
12楼2016-10-18 08:58:18
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卡卡罗特zxg

金虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by liuderong at 2016-10-18 08:58:18
个人的一些建议,不一定对,你最好是找到类似的文献,然后根据文献方法来找。
比如A、B、C三个物种,如果我做的话,我会先找A、B物种的共有基因,然后再用A、B共有的基因调C物种的基因。...

13楼2016-10-18 21:28:42
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