| 查看: 625 | 回复: 0 | ||
[求助]
amber跑轨迹，可以选择性只输出某几个原子的坐标信息吗？
|
| 请问 amber里轨迹文件mdcrd，输出时可以限定只输出某几个原子的坐标信息吗？比如质子转移，H从C1原子转移到C2原子的过程，跑轨迹时，我输出文件只输出C1、C2、H的坐标，因为我要求这三个动态原子两两间的距离在整个质子转移过程中的变化。我了解的有ptraj、cpptraj里distance可以根据轨迹文件分析距离，除去这个，在一开始跑轨迹时，可以进行选择性的输出某些原子坐标信息吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
评审感受-评审感受-评审感受
已经有14人回复
-
求助大佬sci投稿哪个好中
已经有3人回复
-
这年头没有找到涵评专家，还有中面上的可能吗
已经有6人回复
-
2026博士申请求助
已经有10人回复
-
西南大学考核制博士
已经有6人回复
-
窗边初夏的小雨
已经有10人回复
-
护理论文 晋升
已经有4人回复
-
求碳排放博导；方向是LCA、生命周期可持续发展以及碳排放
已经有8人回复
-
26年申博自荐-计算机视觉
已经有5人回复
-
导师各种操作恶心咋办
已经有12人回复