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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 【求助】二价Hg离子用什么基组和赝势合适
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Roseshu

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】二价Hg离子用什么基组和赝势合适

我需要优化的体系 是 一个有机分子络合一个Hg离子，请教大家Hg用什么基组和赝势合适呢？  一般这样的配位键长度在什么范围？
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1楼 2008-04-24 10:25:52
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与，欢迎继续关注计算模拟版！
对于Hg元素，除了常见的一些赝势基组，比如lanl2dz, dgdzvp等，
近几年已经有相关一致基组（cc-pvXZ-pp, X=D,T,Q,5,6）发表出来了，可以更好地描述分子性质，
因此，如果LZ的体系不大，可以使用相关一致基组。
可以在这个网站获得gaussian中没有的基组。
https://bse.pnl.gov/bse/portal
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
2楼2008-04-24 17:06:34
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Roseshu

金虫 (正式写手)
非常感谢楼上，你是计模的常客了
体系有点大的，可能相关一致性基组代价太大了。
还想请问下，有文献上说用“stuttgart relativistic small core basis set （8s8p7d to 6s6p4d contraction）with effective core potential”，这是个什么赝势呢？
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3楼2008-04-24 17:36:05
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by Roseshu at 2008-4-24 17:36:
非常感谢楼上，你是计模的常客了
体系有点大的，可能相关一致性基组代价太大了。
还想请问下，有文献上说用“stuttgart relativistic small core basis set （8s8p7d to 6s6p4d contraction）with effective  ...

如果只有一个Hg，使用aug-cc-pVDZ-pp还是可以承受的，这个基组的大小和6-31+G*差不多，精确性却好了很多。
你提到的这个基组在我给出的那个网站中也能找到，不过好像不比Aug-cc-pVDZ-pp小，获取基组的时候别忘了选择软件类型为Gaussian94，这样得到的是Gaussian格式基组。

[ Last edited by hairan on 2008-4-25 at 09:53 ]
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
4楼2008-04-25 09:50:45
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huahua1981

铜虫 (小有名气)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
#p rb3lyp nosymm guess=core gen pseudo=read scfcyc=300
optcyc=300
C H S 0
6-31g(d,p)
****
Au 0
lanl2dz
****

Au 0
lanl2dz
我的是金的 你的按这个应该没错
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5楼2008-04-25 10:02:37
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by huahua1981 at 2008-4-25 10:02:
#p rb3lyp nosymm guess=core gen pseudo=read scfcyc=300
optcyc=300
C H S 0
6-31g(d,p)
****
Au 0
lanl2dz
****

Au 0
lanl2dz
我的是金的 你的按这个应该没错

lanl2dz这个基组只是double zeta，太小了，你对C H S等使用了6-31g**，那么对金属也应该加上极化函数，至少也要用到cc-pVDZ-pp水平上，弥散函数Aug是否需要加在视情况而定，否则你的体系使用的基组就有些不对称。
如果我是审稿人，肯定对你的基组使用提出质疑。
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
6楼2008-04-25 15:43:37
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huahua1981

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hairan at 2008-4-25 15:43:


lanl2dz这个基组只是double zeta，太小了，你对C H S等使用了6-31g**，那么对金属也应该加上极化函数，至少也要用到cc-pVDZ-pp水平上，弥散函数Aug是否需要加在视情况而定，否则你的体系使用的基组就有些不对 ...

你说的这些我不是太懂 我看了发表的文献 也是这样算得
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7楼2008-04-27 16:39:40
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫
★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by huahua1981 at 2008-4-27 16:39:

你说的这些我不是太懂 我看了发表的文献 也是这样算得

lanl2dz中的dz就是double zeta，有时中文翻译为双收缩基，cc-pVDZ中DZ也是这个意思，如果是三收缩基，英文名称后缀一般是tz(triple zeta)，如cc-pVTZ，常用的6-311g也是三收缩基基组。在相关一致基组系列中还提供了四收缩基以上的基组，分别叫qz，5z，6z等。收缩基数目越多，因为基组产生的误差就越小，前提是有与之相对应弥散和极化函数。
你使用的基组中，lanl2dz只是一个double zeta的基组，默认的基组中没有极化函数，也没有弥散函数，但6-31g(d,p)虽然也是一个double zeta基组，但使用了(d,p)添加极化基组，因此就出现了基组的不对称,所以我才建议使用cc-pVDZ来达到基组的平衡，这样起码审稿人不会因为你的基组使用难为你。
别人发了文章并不一定代表他的基组使用就好，如果体系中有很多个金属，从lanl2dz到cc-pVDZ会增加很大的计算量，为了计算效率的考虑，可以不换，如果只有一两个金属，换过来不会提高很多计算量，但能很大程度提高你的文章在审稿人心中的分量。

[ Last edited by hairan on 2008-4-28 at 22:05 ]
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
8楼2008-04-28 21:42:54
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