24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 1066  |  回复: 7
当前主题已经存档。

Roseshu

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】二价Hg离子用什么基组和赝势合适

我需要优化的体系 是 一个有机分子络合一个Hg离子,请教大家Hg用什么基组和赝势合适呢?  一般这样的配位键长度在什么范围?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
zzgyb(金币+2,VIP+0):谢谢你的参与,欢迎继续关注计算模拟版!
对于Hg元素,除了常见的一些赝势基组,比如lanl2dz, dgdzvp等,
近几年已经有相关一致基组(cc-pvXZ-pp, X=D,T,Q,5,6)发表出来了,可以更好地描述分子性质,
因此,如果LZ的体系不大,可以使用相关一致基组。
可以在这个网站获得gaussian中没有的基组。
https://bse.pnl.gov/bse/portal
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
2楼2008-04-24 17:06:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Roseshu

金虫 (正式写手)

非常感谢楼上,你是计模的常客了
体系有点大的,可能相关一致性基组代价太大了。
还想请问下,有文献上说用“stuttgart relativistic small core basis set (8s8p7d to 6s6p4d contraction)with effective core potential”,这是个什么赝势呢?
3楼2008-04-24 17:36:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by Roseshu at 2008-4-24 17:36:
非常感谢楼上,你是计模的常客了
体系有点大的,可能相关一致性基组代价太大了。
还想请问下,有文献上说用“stuttgart relativistic small core basis set (8s8p7d to 6s6p4d contraction)with effective  ...

如果只有一个Hg,使用aug-cc-pVDZ-pp还是可以承受的,这个基组的大小和6-31+G*差不多,精确性却好了很多。
你提到的这个基组在我给出的那个网站中也能找到,不过好像不比Aug-cc-pVDZ-pp小,获取基组的时候别忘了选择软件类型为Gaussian94,这样得到的是Gaussian格式基组。

[ Last edited by hairan on 2008-4-25 at 09:53 ]
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
4楼2008-04-25 09:50:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huahua1981

铜虫 (小有名气)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
#p rb3lyp nosymm guess=core gen pseudo=read scfcyc=300
optcyc=300
C H S 0
6-31g(d,p)
****
Au 0
lanl2dz
****

Au 0
lanl2dz
我的是金的 你的按这个应该没错
5楼2008-04-25 10:02:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by huahua1981 at 2008-4-25 10:02:
#p rb3lyp nosymm guess=core gen pseudo=read scfcyc=300
optcyc=300
C H S 0
6-31g(d,p)
****
Au 0
lanl2dz
****

Au 0
lanl2dz
我的是金的 你的按这个应该没错

lanl2dz这个基组只是double zeta,太小了,你对C H S等使用了6-31g**,那么对金属也应该加上极化函数,至少也要用到cc-pVDZ-pp水平上,弥散函数Aug是否需要加在视情况而定,否则你的体系使用的基组就有些不对称。
如果我是审稿人,肯定对你的基组使用提出质疑。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
6楼2008-04-25 15:43:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huahua1981

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by hairan at 2008-4-25 15:43:


lanl2dz这个基组只是double zeta,太小了,你对C H S等使用了6-31g**,那么对金属也应该加上极化函数,至少也要用到cc-pVDZ-pp水平上,弥散函数Aug是否需要加在视情况而定,否则你的体系使用的基组就有些不对 ...

你说的这些我不是太懂 我看了发表的文献 也是这样算得
7楼2008-04-27 16:39:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by huahua1981 at 2008-4-27 16:39:

你说的这些我不是太懂 我看了发表的文献 也是这样算得

lanl2dz中的dz就是double zeta,有时中文翻译为双收缩基,cc-pVDZ中DZ也是这个意思,如果是三收缩基,英文名称后缀一般是tz(triple zeta),如cc-pVTZ,常用的6-311g也是三收缩基基组。在相关一致基组系列中还提供了四收缩基以上的基组,分别叫qz,5z,6z等。收缩基数目越多,因为基组产生的误差就越小,前提是有与之相对应弥散和极化函数。
你使用的基组中,lanl2dz只是一个double zeta的基组,默认的基组中没有极化函数,也没有弥散函数,但6-31g(d,p)虽然也是一个double zeta基组,但使用了(d,p)添加极化基组,因此就出现了基组的不对称,所以我才建议使用cc-pVDZ来达到基组的平衡,这样起码审稿人不会因为你的基组使用难为你。
别人发了文章并不一定代表他的基组使用就好,如果体系中有很多个金属,从lanl2dz到cc-pVDZ会增加很大的计算量,为了计算效率的考虑,可以不换,如果只有一两个金属,换过来不会提高很多计算量,但能很大程度提高你的文章在审稿人心中的分量。

[ Last edited by hairan on 2008-4-28 at 22:05 ]
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
8楼2008-04-28 21:42:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Roseshu 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 294求调剂 +15 淡然654321 2026-04-15 15/750 2026-04-19 08:20 by cuisz
[考研] 0854求调剂 +23 门路摸摸 2026-04-15 27/1350 2026-04-19 01:59 by 烟雨流涯
[考研] 生物学调剂 +10 纸扇zhishan 2026-04-13 10/500 2026-04-18 21:19 by zqndavala
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[考研] 化工学硕294分,求导师收留 +33 yzyzx 2026-04-12 37/1850 2026-04-17 23:00 by wunaiy88
[考博] 求博导|生物质基多孔碳/超级电容方向,已有相关成果,寻能源材料/碳材料方向老师 +3 猪猪人Zzz 2026-04-12 3/150 2026-04-17 19:10 by 阳阳阳^_^
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 297,工科调剂?河南农业大学本科 +14 河南农业大学-能 2026-04-14 14/700 2026-04-16 14:41 by dingyanbo1
[考研] 求调剂推荐 +8 小聂爱学习 2026-04-14 8/400 2026-04-16 07:22 by 学员JpLReM
[考研] 297,工科调剂? +10 河南农业大学-能 2026-04-14 10/500 2026-04-15 21:50 by noqvsozv
[考研] 通信工程求调剂!!! +6 zlb770521 2026-04-14 6/300 2026-04-15 20:00 by 学员JpLReM
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +19 电气李 2026-04-13 21/1050 2026-04-15 13:37 by 黑科技矿业
[考研] 085408光电信息工程专硕355一志愿长春光机所调剂 +6 王ymaa 2026-04-13 13/650 2026-04-14 11:33 by 王ymaa
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +16 李木子啊哈哈 2026-04-12 17/850 2026-04-14 09:11 by fenglj492
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] B区0809 ,数一英一,290 求调剂 +3 泠潍1111 2026-04-12 4/200 2026-04-13 20:35 by 学员JpLReM
[考研] 339求调剂 +4 hanwudada 2026-04-12 4/200 2026-04-13 12:03 by 蓝云思雨
信息提示
请填处理意见