24小时热门版块排行榜    

查看: 2029  |  回复: 3

李少珂

铜虫 (初入文坛)

[求助] 紧急求助:微卫星(SSR)数据分析,想用popgene32,怎样将条带数据转化成基因型数据? 已有1人参与

紧急求助:微卫星(SSR)数据分析,想用popgene32,怎样将条带数据转化成基因型数据?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dsrocean

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

请参考如下格式,仅供参考(0,1矩阵用于rapd类,ssr是否可以用0,1,2来表示呢?)
说明文字
群体数目=?
位点数目
位点名称(对应位点数目个数)
群体一
第一个位点有条带1,没有条带0.(第一个个体)
第一个位点有条带1,没有条带0.(第二个个体)
……

群体二
群体三
……=群体数目
2楼2014-10-01 11:17:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dsrocean

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我做的一个ssr数据这样的格式:(竖列1-11表示个体,在popgene中应该可以省掉,横行上面为位点,一个位点两等位基因,群体中为多态,故数值较大,一个ssr位点分为两个等位基因位置)(请参考)(许多年没用了,细节忘记了。)
        EN0018a        EN0018b        EN0033a        EN0033b        RS062a        RS062b        RS0622a        RS0622b        RS0653a        RS0653b        RS0683a        RS0683b        RS0859a        RS0859b        RS0956a        RS0956b
1        4        4        4        9        1        4        4        5        2        3        8        8        2        3        1        1
2        4        4        9        14        2        5        4        6        2        4        11        13        2        3        1        6
3        5        6        4        7        6        6        5        7        2        5        4        11        3        4        3        3
4        3        3        3        5        1        3        2        4        5        5        11        12        3        4        2        4
5        4        5        2        13        1        4        3        5        3        4        9        10        3        4        2        2
6        3        5        2        13        1        4        3        5        2        4        8        9        3        5        2        6
7        5        6        5        8        6        6        7        7        2        4        4        6        3        3        2        5
8        3        3        5        11        3        5        4        5        3        3        8        9        5        6        4        4
9        4        6        2        6        1        3        2        4        2        2        9        11        5        6        6        6
10        3        3        11        16        2        3        3        4        3        3        13        13        3        5        5        7
11        5        5        5        8        3        6        4        6        3        3        3        11        4        4        4        5
3楼2014-10-01 11:23:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kxs2001

金虫 (著名写手)

我知道,主爱我!
4楼2017-03-04 20:34:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 李少珂 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +8 基诺咪客 2026-08-17 11/550 2026-08-18 17:13 by 悠然熊猫
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +50 医学老男孩 2026-08-13 109/5450 2026-08-18 16:56 by 医学老男孩
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +9 yuleib84 2026-08-18 10/500 2026-08-18 16:52 by archvillain
[教师之家] 两姐妹,一个辛辛苦苦30岁工作当大学教师,另一个23岁就工作当开车教练 +3 瞬息宇宙 2026-08-11 7/350 2026-08-18 16:42 by LNP@mRNA
[基金申请] 明天放榜? +4 Shxjjxjkx 2026-08-18 4/200 2026-08-18 15:59 by abcabc1133
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见