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fengshiquan铁杆木虫 (正式写手)
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MS建模问题 已有1人参与
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| 已经用gaussview建立一个离子液体对，并导入到MS中了，请问如何在MS中建立盒子、添加一定数目的离子液体，请各位虫友指教，谢谢 |
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
fengshiquan: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢你的回复，我去试一下，有问题再请教你 2014-09-22 21:56:19
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你在GaussianView里不必建离子对啊，就建单个离子，因为离子在溶液环境下是分散的，然后将离子分别倒入到MS，赋予它们力场和电荷，然后在MS里有一个Amorphous Cell模块，选calculation，出来一个选择框，选中你要加入的离子和在其右边水设置好粒子个数，设置好密度，还有其他的一些设置，如力场、范得华力和静电力。这样就可以了。 另，若你不知道准确密度，可先设一个大概密度，然后NPT跑动力学，从输出文件里就可以知道准确密度了 |
2楼2014-09-22 09:06:41
fengshiquan
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3楼2014-09-22 22:44:50
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4楼2014-09-23 09:41:02
30