应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 小白求助SYBYL做小分子对接的问题~~
101/1返回列表
查看: 1369  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

南海猪

金虫 (著名写手)

The only one

[求助] 小白求助SYBYL做小分子对接的问题~~ 已有2人参与

虫友们~~~小弟刚接触SYBYL做小分子对接~~~我现在有几个问题想请教一下：（1）做对接的时候生成promotol，这个promotol干啥用的？（2）为什么我导入MOL2文件，设置protomol generation mode 为automatic，生成的东西一团，我的那个MOL2小分子被包围在一团化学键里面，这是什么情况？小白求助啊~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
出来混，不是你帮我就是我帮你~~~
1楼 2014-09-20 11:27:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

向罗琦琦靠近

新虫 (初入文坛)
麻烦问一下，用小木虫怎么下载sybyl软件啊？
赞一下 回复此楼
2楼2014-09-20 16:39:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

患难知己

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
南海猪: 金币+50, ★★★★★最佳答案 2014-10-11 10:29:36
917265908在学这个，求交流！

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2014-09-21 00:27:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南海猪

金虫 (著名写手)

The only one
引用回帖:
2楼: Originally posted by 向罗琦琦靠近 at 2014-09-20 16:39:13
麻烦问一下，用小木虫怎么下载sybyl软件啊？

我给你发一份~~怎么弄~~你把你百度网盘，用户名及密码给我，我上传之后，你再把密码改回来~~~怎么样？
赞一下 回复此楼
出来混，不是你帮我就是我帮你~~~
4楼2014-09-21 08:11:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南海猪

金虫 (著名写手)

The only one
引用回帖:
3楼: Originally posted by 患难知己 at 2014-09-21 00:27:37
917265908在学这个，求交流！

好~~看来咱们要从小白做起~~~同舟共济了~~~
赞一下 回复此楼
出来混，不是你帮我就是我帮你~~~
5楼2014-09-21 08:12:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南海猪

金虫 (著名写手)

The only one
引用回帖:
3楼: Originally posted by 患难知己 at 2014-09-21 00:27:37
917265908在学这个，求交流！

我已经加了~~~
回复此楼
出来混，不是你帮我就是我帮你~~~
6楼2014-09-21 08:15:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

患难知己

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 南海猪 at 2014-09-21 08:12:00
好~~看来咱们要从小白做起~~~同舟共济了~~~...

嗯，呵呵，一直想找个人一起学，相互交流，我以前学过一点点，不清不楚的，我有些视频，等有时间发给你看看！

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
7楼2014-09-21 13:59:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

石沉大海

新虫 (初入文坛)
给金币
回复此楼
8楼2014-09-23 15:47:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南海猪

金虫 (著名写手)

The only one
引用回帖:
8楼: Originally posted by 石沉大海 at 2014-09-23 15:47:02
给金币

点击应助~~~不然我这边给不了~~~
赞一下 回复此楼
出来混，不是你帮我就是我帮你~~~
9楼2014-09-23 16:52:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bobbycn

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

生成的protomol是受体对接位点的信息，用于对接小分子时能快速计算score

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
10楼2014-09-24 01:10:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 南海猪 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode +6 documentary 2026-08-10 6/300 2026-08-10 17:09 by wdc28
[基金申请] 我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人 +8 家与远方 2026-08-10 11/550 2026-08-10 17:09 by 六两废铜
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] FileCode能看出啥？ +4 要乐观耀哥 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:02 by 天神眷顾
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +14 Lanmanbaby 2026-08-09 22/1100 2026-08-10 14:57 by wwncly
[基金申请] 8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力 +11 archvillain 2026-08-04 13/650 2026-08-10 14:41 by seekfind
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制，评价高的钱多评价低的钱少，但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的？有收到消息的吗？ +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭