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lxying

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 输入文件求助 已有1人参与

有一gaussian输入文件,不知道分子结构之后的部分表示什么意思,求解释。
例子如下:
#p opt=tight  B3lyp/6-311++g(d,p) geom=connectivity

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0 1
C                 -0.13262500    0.41646300   -0.28543700
C                  0.84714300   -0.56889500   -0.43348100
C                  0.47428500   -1.90201800   -0.29821700
C                 -0.84478100   -2.25489500   -0.02383200
C                 -1.80889100   -1.27356500    0.12072600
C                 -1.44669600    0.07199400   -0.01166400
H                  0.12524900    1.46660000   -0.39017100
H                  1.22031200   -2.68189900   -0.41249800
H                 -1.13842300   -3.29311900    0.07794200
O                 -3.09906000   -1.60786700    0.38360700
H                 -3.60435000   -0.79075500    0.44166900
O                 -2.46356000    0.96569800    0.14093900
H                 -2.14278300    1.87682100    0.05344200
C                  2.28133800   -0.17669700   -0.68418500
H                  2.80336400   -1.00083400   -1.18418700
H                  2.33506700    0.68499500   -1.35642700
C                  3.02303700    0.17079700    0.60748200
H                  2.95132300   -0.68480000    1.29657000
H                  2.51557300    1.01069900    1.09277500
O                  4.39586100    0.57786700    0.31621200
H                  4.87875800    0.85489500    1.16205400
H                  4.91771900   -0.19294400   -0.08549100
C                 -3.28488846    2.01979641   -1.92941037
H                 -3.48815788    2.55543576   -2.83310944
H                 -3.23986783    2.70659740   -1.11015611
H                 -2.34824827    1.51043086   -2.01969817
C                 -4.40519019    0.99350212   -1.67792660
N                 -4.36731190    0.25018434   -0.66322740
N                 -5.49224492    0.88482086   -2.60064021
H                 -6.09978255    0.20441914   -2.30138861

1 2 1.5 6 2.0 7 1.0
2 3 1.5 14 1.0
3 4 1.5 8 1.0
4 5 2.0 9 1.0
5 6 1.5 10 1.0
6 12 1.0
7
8
9
10 11 1.0
11
12 13 1.0
13
14 15 1.0 16 1.0 17 1.0
15
16
17 18 1.0 19 1.0 20 1.0
18
19
20 21 1.0 22 1.0
21
22
23 24 1.0 25 1.0 26 1.0 27 1.0
24
25
26
27 28 2.0 29 1.0
28
29 30 1.0
30

请问下边的数字输入是什么意思?
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

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lxying: 金币+5, ★★★很有帮助, 有用,但是不太详细,我已经查资料弄懂了,谢谢! 2014-09-18 17:44:16
下边的数字对应于geom=connectivity,是原子间的成键形式或者说键长,但是高斯计算不看这个的,所以一般可以连同geom=connectivity一起删掉
2楼2014-09-18 08:38:45
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