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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » 【求助】怎样得到电荷密度图
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ocean08

木虫 (著名写手)

做人要开心

[交流] 【求助】怎样得到电荷密度图

弱弱的问一下，在许多文献中都看到电荷密度图，请问他是怎么算出来的？在castep中如何得到如下图所示这样的电荷密度图？
请各位大侠不吝赐教

[ Last edited by freshgirl on 2009-6-26 at 16:31 ]
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以一无所知和无所不知的方式去思考；以即将赴死和永生不死的态度去生活。
1楼 2008-04-22 09:30:04
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hchfox

木虫 (正式写手)
★ ★
spur(金币+2,VIP+0):3Q!感谢参与！
说得这么详细也没什么大用处；CASTEP中得到的chg_diff是unformated文件，不知道它的写入方式能正确读吗?除非你知道它的源代码，知道怎么写入的，那一切就好办了，写个简单程序就可搞定；可这就是CASTEP的烦人地方，上手很快，但一切都给你屏蔽了，想美化也难啊，还是VASP用起来爽...
引用回帖:
Originally posted by hopingzmn at 2008-4-22 09:40:
这个是一个重要的问题哦，曾在看到如何画，大致是这么说的：


没有实践过，关键不会用matlab……
MS也可以得到二维的电荷密度图，只是不是你附件中这种等高线形式的
盼实践过的高手具体指导一下

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18楼2008-05-26 14:50:17
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hopingzmn

金虫 (知名作家)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢
ocean08(金币+5,VIP+0):谢谢你啊！Matlab我也不懂啊，期望有比较简单的方法。
这个是一个重要的问题哦，曾在看到如何画，大致是这么说的：
引用回帖:
MS结果文件夹中*.grd文件内存储的是三维空间各点的电荷密度值，利用这个数据就可以得到二维的电荷密度等值线图,应该有专门的软件能画,不过用matlab编自己编程序也不难，其中关键命令是contourslice，实现在某一平面内绘制等高线
grd 文件是隐藏的，可以去结果文件找，电荷密度的应该是***_density.grd,如果同时计算了其它性质应该还有其它grd文件，如***_homo.grd，***_lumo.grd
contourslice 的格式是 contourslice（x,y,z,v,x1,y1,z1）,其中x,y,z都是三维矩阵，定义一个空间网格，v是网格上各个点的值，在这里就是输出的电荷密度值；x1，y1，z1用来定义选择的截面，正确输入contourslice后就会绘制出该平面上的电荷密度等高线图

这个说的是dmol中电荷密度的画法，在castep中电荷密度的数据保存在×.charg_frm中。

没有实践过，关键不会用matlab……
MS也可以得到二维的电荷密度图，只是不是你附件中这种等高线形式的
盼实践过的高手具体指导一下
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淡定
2楼2008-04-22 09:40:48
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ocean08

木虫 (著名写手)

做人要开心
还望各位带下不吝赐教啊！到底这些图是怎么得到？
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以一无所知和无所不知的方式去思考；以即将赴死和永生不死的态度去生活。
3楼2008-04-22 16:32:55
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hopingzmn

金虫 (知名作家)
★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢
引用回帖:
Originally posted by ocean08 at 2008-4-22 16:32:
还望各位带下不吝赐教啊！到底这些图是怎么得到？

见过和这个Fig 5很类似的图，在那个华南师范的Materials Studio上面有一个例子——“Pd(110)面上的CO 分子电荷密度变化”，讲解了如何画这种图，可以下载看看，下面有个链接：
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=403017&fpage=2
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淡定
4楼2008-04-22 16:48:36
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