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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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jlz3278

金虫 (小有名气)

[交流] [求助]AUTODOCK4的注意事项

我是用ADT4做的,只是做刚性的,没有确定柔性集团,为什么不管做什么,配体都是在蛋白质边上跑呢??
求助啊!!!
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luai071

木虫 (著名写手)


小红豆(金币+1,VIP+0):ganxie.
问题还没有解决吗,先做下tutorial里面的例子吧
2楼2008-04-21 13:35:12
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jlz3278

金虫 (小有名气)

还没有啊,还是在边上乱跑,例子也做了,要不你看你这周什么时候有空,我去你学校请教下吧?
3楼2008-04-21 15:34:10
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luai071

木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢关注
先别急,我们分析下。你做例子有没有出现“边上乱跑”的现象?
4楼2008-04-21 18:47:25
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jlz3278

金虫 (小有名气)

今天又仔细的做了下,貌似是我在设置刚性基团那步错了,我做的蛋白质太大了,我想用DOCKING的结果用到MD里,那我怎么截取呢?
5楼2008-04-22 12:41:03
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luai071

木虫 (著名写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
你再做下dlg转为PDB,做MD时用PDB文件就可以了
6楼2008-04-22 22:30:00
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