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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » [求助]AUTODOCK4的注意事项
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jlz3278

金虫 (小有名气)

[交流] [求助]AUTODOCK4的注意事项

我是用ADT4做的，只是做刚性的，没有确定柔性集团，为什么不管做什么，配体都是在蛋白质边上跑呢？？
求助啊！！！
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1楼2008-04-21 13:19:59
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luai071

木虫 (著名写手)
★
小红豆(金币+1,VIP+0):ganxie.
问题还没有解决吗，先做下tutorial里面的例子吧
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2楼2008-04-21 13:35:12
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jlz3278

金虫 (小有名气)
还没有啊，还是在边上乱跑，例子也做了，要不你看你这周什么时候有空，我去你学校请教下吧？
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3楼2008-04-21 15:34:10
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luai071

木虫 (著名写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢关注
先别急，我们分析下。你做例子有没有出现“边上乱跑”的现象？
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4楼2008-04-21 18:47:25
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jlz3278

金虫 (小有名气)
今天又仔细的做了下，貌似是我在设置刚性基团那步错了，我做的蛋白质太大了，我想用DOCKING的结果用到MD里，那我怎么截取呢？
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5楼2008-04-22 12:41:03
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luai071

木虫 (著名写手)
★
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢
你再做下dlg转为PDB，做MD时用PDB文件就可以了
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6楼2008-04-22 22:30:00
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