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liujs2007

铜虫 (初入文坛)

[求助] 基因组survey 已有1人参与

哪位虫友做过基因组survey?

就是我们有个基因组没有测序,我们想做de novo测序,在这之前我们会测个小插入片段库,来评估下1. 基因组大小;2. 杂合度;3. GC-depth分布;4. 重复序列分布
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liujs2007

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bullfrog325 at 2014-09-09 20:54:10
考虑用PAC-BIO 测序技术

呵呵,你没明白我的意思,我们用的普通高通量测序技术。
3楼2014-09-11 20:19:28
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bullfrog325

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
liujs2007(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-10 08:54:53
考虑用PAC-BIO 测序技术
2楼2014-09-09 20:54:10
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laixianj

新虫 (初入文坛)

请问你的问题解决了吗?另外请教一下你们是怎么评估杂合度的呢?
4楼2015-06-18 16:46:21
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