24小时热门版块排行榜    

查看: 1634  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yangmou

木虫 (小有名气)

[求助] 一个四原子自由基COONa怎么也优化不出来了!!!!! 已有2人参与

输入文件
%mem=4GB
%nprocshared=8
%chk=COONa-2.chk
#p opt=calcall freq=noraman ub3lyp/6-311+g(d,p) nosymm
scf=(qc,maxcycle=365,tight)

COONa

0 2
C              
O                  1            B1
O                  1            B2    2            A1
Na                 3            B3    1            A2    2            D1    0

   B1             1.24377491
   B2             1.24386992
   B3             2.42551046
   A1           133.73088482
   A2            81.25155496
   D1            21.67057927


最后输出:
Maximum Force            0.111497     0.000450     NO
RMS     Force            0.045425     0.000300     NO
Maximum Displacement          NaN     0.001800     YES
RMS     Displacement          NaN     0.001200     YES
Predicted change in Energy=          NaN
GradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGradGrad

                          Input orientation:                          
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic      Atomic             Coordinates (Angstroms)
Number     Number       Type             X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
      1          6           0             NaN         NaN         NaN
      2          8           0             NaN         NaN         NaN
      3          8           0             NaN         NaN         NaN
      4         11           0             NaN         NaN         NaN
---------------------------------------------------------------------
                    Distance matrix (angstroms):
                    1          2          3          4
     1  C    0.000000
     2  O    0.000000   0.000000
     3  O    0.000000   0.000000   0.000000
     4  Na   0.000000   0.000000   0.000000   0.000000
Small interatomic distances encountered:      2     1     3     1     3     2     4     1     4     2
Small interatomic distances encountered:      4     3
Problem with the distance matrix.
Error termination via Lnk1e in /public1/software/gaussian09/g09/l202.exe at Sat Sep  6 11:09:40 2014.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 55.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     83 Int=      0 D2E=      0 Chk=      2 Scr=      2



我用了各种基组和加不同关键词就是总遇到这个错误,构型也调整过了,也换过不同机器。
这是我投稿的一篇文章里计算出来的裂解产物COONa自由基。我原来算出来的是这种构型:
一个四原子自由基COONa怎么也优化不出来了!!!!!
所以我认为COONa会解离为CO2和Na原子,不能稳定存在。审稿人说可以出现这种稳定构型:
一个四原子自由基COONa怎么也优化不出来了!!!!!-1
并且给我列出了详细的图和几何参数,计算出来的频率(上图)。我就是怎么也优化不出审稿人说的构型,为什么啊,求救啊 啊;啊; !!!!!!

那位牛人帮我用 cbs-qb3 geom=connectivity nosym scf=(tight,maxcycle=5000)方法算一下啊,多谢了啊
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangmou

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gauss98 at 2014-09-09 12:48:00
用B3LYP-D3  6-311+G** 优化你的 第二个结果
E(UB3LYP) =  -350.934411163
! R1    R(1,2)                  1.2359         -DE/DX =   -0.0001              !
! R2    R(1,3)                  1.2359    ...

,b3lyp/6-311+g(d,p) 和 cbs-qb3这两个方法能优化出来么,我其他分子都是用的这种方法,所以想一致起来。
3楼2014-09-09 17:24:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

gauss98

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhou2009: 金币+8 2014-09-09 14:56:05
本帖内容被屏蔽

2楼2014-09-09 12:48:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gauss98

禁虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yangmou: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-09-10 18:38:06
本帖内容被屏蔽

4楼2014-09-10 11:13:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gauss98

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

5楼2014-09-10 11:14:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 什么时候开奖? +4 CrisMessi 2026-08-18 4/200 2026-08-19 00:53 by gatelove
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 27/1350 2026-08-18 21:44 by Noways
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 9/450 2026-08-18 20:09 by 奶牛小黑
[基金申请] 朋友圈看到的 +4 wangzilk 2026-08-18 5/250 2026-08-18 19:25 by wangzilk
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +8 基诺咪客 2026-08-17 11/550 2026-08-18 17:13 by 悠然熊猫
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +9 yuleib84 2026-08-18 10/500 2026-08-18 16:52 by archvillain
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见