| 查看: 2707 | 回复: 18 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
Affymetrix表达谱芯片数据如何跨平台比较？探针如何对应？
|
|||
|
比如我用GPL570平台，Affymetrix HG-U133_Plus_2做的表达谱数据，找出了异常表达的基因探针。但是我又需要查找这些探针在GPL96平台，HG-U133A下的对应探针，即跨平台探针比较。 我现在的做法是利用Affymetrix网站的Query Search，先把HG-U133_Plus_2的探针找出对应的Gene Symbol，然后再反过来找对应的HG-U133A探针。可是这里面出现一个问题，就是两个平台的探针不再是一一对应关系。当然，它们可以不一一对应，可问题是当出现一个HG-U133_Plus_2的探针对应于多个HG-U133A探针时，是全部留下还是如何取舍呢？从Affymetrix网站“Home > Support > Microarray Technical Documentations > Array Comparison ”找了一圈，说是探针比较可以有Good match和Best match。如果能对上Best match那当然是好，可是不属于这两种情况下，又该怎么看比较结果呢？ 总之一句话，我就是想把HG-U133_Plus_2的探针对应到HG-U133A，如何做到？出现一对多的情况下，如何取舍？ 因为本人刚接触表达谱，不知道我的问题是不是很业余，请海涵，谢谢指教！  |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有168人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 数字基因表达谱后续工作
已经有24人回复
- 有没有人做过植物基因表达谱？怎么从公司给出的分析结果中挖掘数据呢？
已经有10人回复
- 下载芯片数据后，如何制作自己所需基因的表达谱？
已经有4人回复
- 基因芯片表达谱分析领域会过时淘汰吗？
已经有11人回复
- 【资料】Affymetrix基因表达谱芯片操作指南（中文版）
已经有124人回复
- 【求助/交流】基因芯片哪个公司做得好？多少钱一张？
已经有19人回复
- 生物信息学专题－生物版，医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
985教授征女友
+1/247
-
西湖大学拓扑光学、非厄米光学、太赫兹方向博士后招聘
+2/224
-
石河子大学化学化工学院CJ学者领衔分子炼油团队招收博士、硕士。【接收调剂】
+1/83
-
江西理工大学联合中国科学院赣江创新研究院招收2026级博士研究生
+1/81
-
龙凤Tai——写给恋人的第100封情书
+1/78
-
好玩的不敢搞，能搞的不挣钱，能挣钱的我不会做
+1/66
-
坐标广州，征女友
+2/58
-
罗格斯大学纽瓦克校区(Rutgers-Newark) 招收 PHD，计算材料物理方向
+1/35
-
上海交通大学-宁波东方理工大学联合培养博士生
+1/21
-
大叔征婚
+1/17
-
中科院深圳先进技术研究院招聘免疫及计算生物学方向博士后、科研助理或联培学生
+1/9
-
国家“双一流”建设高校-南京林业大学-国家级青年人才团队 招2026级申请考核制博士
+1/9
-
华南师范大学（211）- 光电科学与工程学院 - 申请审核制（2026年4-5月份面试考核）
+2/6
-
【东南大学博士后、科研助理招聘】
+1/5
-
澳科大招收2026秋季全奖博士研究生（药剂学/生物材料方向，3月5日18:00截止）
+1/5
-
澳科大招收2026年秋季药剂学/生物材料方向全奖博士研究生（春节不打烊）
+1/4
-
国内树枝状聚合物现在进入量产了吗？
+1/3
-
26储能博士申请自荐
+1/1
-
斯德哥尔摩 DigitalFuture 博士后奖学金机会！
+1/1
-
大连海事大学船舶洁净能源研究中心2026年博士研究生招生启事
+1/1
19楼2015-06-22 02:46:05
简单回复
假大空6楼
2014-09-08 16:33
回复
Movchan(金币+2): 谢谢参与
