| 查看: 2750 | 回复: 18 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
Affymetrix表达谱芯片数据如何跨平台比较？探针如何对应？
|
|||
|
比如我用GPL570平台，Affymetrix HG-U133_Plus_2做的表达谱数据，找出了异常表达的基因探针。但是我又需要查找这些探针在GPL96平台，HG-U133A下的对应探针，即跨平台探针比较。 我现在的做法是利用Affymetrix网站的Query Search，先把HG-U133_Plus_2的探针找出对应的Gene Symbol，然后再反过来找对应的HG-U133A探针。可是这里面出现一个问题，就是两个平台的探针不再是一一对应关系。当然，它们可以不一一对应，可问题是当出现一个HG-U133_Plus_2的探针对应于多个HG-U133A探针时，是全部留下还是如何取舍呢？从Affymetrix网站“Home > Support > Microarray Technical Documentations > Array Comparison ”找了一圈，说是探针比较可以有Good match和Best match。如果能对上Best match那当然是好，可是不属于这两种情况下，又该怎么看比较结果呢？ 总之一句话，我就是想把HG-U133_Plus_2的探针对应到HG-U133A，如何做到？出现一对多的情况下，如何取舍？ 因为本人刚接触表达谱，不知道我的问题是不是很业余，请海涵，谢谢指教！  |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有166人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
-
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 数字基因表达谱后续工作
已经有24人回复
- 有没有人做过植物基因表达谱？怎么从公司给出的分析结果中挖掘数据呢？
已经有10人回复
- 下载芯片数据后，如何制作自己所需基因的表达谱？
已经有4人回复
- 基因芯片表达谱分析领域会过时淘汰吗？
已经有11人回复
- 【资料】Affymetrix基因表达谱芯片操作指南（中文版）
已经有124人回复
- 【求助/交流】基因芯片哪个公司做得好？多少钱一张？
已经有19人回复
- 生物信息学专题－生物版，医学版和信息科学版共同创建
已经有87人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
武汉征男友
+1/270
-
讲师身份申请面上项目中标率有影响吗
+1/75
-
合肥工科211水利工程调剂招生
+1/54
-
坐标广州，征女友
+2/50
-
济南大学水利与环境学院赵艳侠简介
+1/42
-
广东省五邑大学光电催化团队接受研究生调剂
+1/38
-
招收2名土木工程方向硕士研究生
+1/37
-
沈阳农业大学生物与医药专硕招收调剂生！！！！！！！！！！
+1/37
-
浙江省人民医院博士后岗位招聘
+1/33
-
哈尔滨工业大学（深圳）-何自开教授团队诚招化学工程与技术专业博士研究生
+1/30
-
天津理工大学国家杰青王铁团队招聘
+1/29
-
招聘科研助理——储能方向（储能、流体传热、CFD模拟）
+1/18
-
中国地震局地质研究所+地球物理专业+接收调剂
+1/10
-
中国地质大学（北京)工程技术学院安老师组招收2026调剂生
+1/9
-
天津理工大学国家杰青王铁团队招聘学术骨干、博士后
+1/9
-
宁夏大学化学化工学院魏逸彬研究员课题组招聘启事
+1/7
-
上海交通大学陈倩栎课题组招收2026年申请-考核博士生1名（能源材料方向）
+1/7
-
上海师范大学有机化学专业研究生招生
+1/2
-
海南师范大学 孙元元老师团队招2026级硕士生2名
+1/1
-
南昌航空大学拟招收飞行器设计或计算空气动力学研究方向博士生 1名
+1/1
19楼2015-06-22 02:46:05
简单回复
假大空6楼
2014-09-08 16:33
回复
Movchan(金币+2): 谢谢参与
