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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Multiwfn » 程序突然关闭的问题。
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panger

金虫 (小有名气)

[求助] 程序突然关闭的问题。 已有1人参与

用Multiwfn做了一个很大的体系，想看看体系表面的静电势分布。可能由于电脑系统的问题，结果在计算完成以后，程序突然自己消失了。整整跑了3天半了，结果还能拿到吗？还是必须得重新计算呢？
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1楼 2014-08-30 16:35:58
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panger

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-08-30 20:22:09
如果在计算之后没有把分子表面顶点的数据导出成文本文件，只能重新算。
对于很大的体系或者基组很大的情况，建议你借助cubegen来生成分子表面静电势值并在Multiwfn里分析，对于你的体系可能总耗时能节省一个数量级 ...

谢谢您，还有个问题得麻烦您。关于“借助cubegen来生成分子表面静电势值”。手册上写的调用cubegen是在gaussian里面吗？gaussian软件的utilities基本上没有用过。不是很清楚手册上您写的命令应该怎么输入。
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3楼2014-09-03 17:45:42
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-08-31 04:36:22
panger: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-09-01 09:30:04
如果在计算之后没有把分子表面顶点的数据导出成文本文件，只能重新算。
对于很大的体系或者基组很大的情况，建议你借助cubegen来生成分子表面静电势值并在Multiwfn里分析，对于你的体系可能总耗时能节省一个数量级以上。具体做法见最新版本的Multiwfn手册的4.12.7节的part2
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2楼2014-08-30 20:22:09
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
引用回帖:
3楼: Originally posted by panger at 2014-09-03 17:45:42
谢谢您，还有个问题得麻烦您。关于“借助cubegen来生成分子表面静电势值”。手册上写的调用cubegen是在gaussian里面吗？gaussian软件的utilities基本上没有用过。不是很清楚手册上您写的命令应该怎么输入。...

是的，cubegen就在高斯的安装目录下。进入DOS，然后进高斯安装目录，然后输入手册里给出的那条cubegen命令就行了。然后cubegen就会把输入的文本文件里的坐标的每个点的静电势数据都算出来，然后让Multiwfn读取产生的这个文件就行了
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4楼2014-09-04 00:30:32
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panger

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2014-09-04 00:30:32
是的，cubegen就在高斯的安装目录下。进入DOS，然后进高斯安装目录，然后输入手册里给出的那条cubegen命令就行了。然后cubegen就会把输入的文本文件里的坐标的每个点的静电势数据都算出来，然后让Multiwfn读取产生 ...

现在我做的体系大概有110个原子左右，其中大概含有15个过渡金属(Pd)，利用Multiwfn载入wfn文件能够完美的做各种分析，结果也非常好。现在尝试用您跟我说的利用cubegen来生成分子表面静电势值的方法分析时出了点小问题。对于小分子我试过了。利用cubgen也能完美解决，但是对于我的含催化剂体系，在载入.fch文件以后，程序会闪退？我也尝试过30个原子以内的催化剂，结果仍然是闪退。为什么.wfn文件没有任何问题，而.fch文件就会出问题呢？你觉得可能是哪里出错了。谢谢。
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5楼2014-09-04 11:22:27
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