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panger

金虫 (小有名气)

[求助] 程序突然关闭的问题。 已有1人参与

用Multiwfn做了一个很大的体系,想看看体系表面的静电势分布。可能由于电脑系统的问题,结果在计算完成以后,程序突然自己消失了。整整跑了3天半了,结果还能拿到吗?还是必须得重新计算呢?
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-08-31 04:36:22
panger: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-09-01 09:30:04
如果在计算之后没有把分子表面顶点的数据导出成文本文件,只能重新算。
对于很大的体系或者基组很大的情况,建议你借助cubegen来生成分子表面静电势值并在Multiwfn里分析,对于你的体系可能总耗时能节省一个数量级以上。具体做法见最新版本的Multiwfn手册的4.12.7节的part2
2楼2014-08-30 20:22:09
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panger

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sobereva at 2014-08-30 20:22:09
如果在计算之后没有把分子表面顶点的数据导出成文本文件,只能重新算。
对于很大的体系或者基组很大的情况,建议你借助cubegen来生成分子表面静电势值并在Multiwfn里分析,对于你的体系可能总耗时能节省一个数量级 ...

谢谢您,还有个问题得麻烦您。关于“借助cubegen来生成分子表面静电势值”。手册上写的调用cubegen是在gaussian里面吗?gaussian软件的utilities基本上没有用过。不是很清楚手册上您写的命令应该怎么输入。
3楼2014-09-03 17:45:42
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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引用回帖:
3楼: Originally posted by panger at 2014-09-03 17:45:42
谢谢您,还有个问题得麻烦您。关于“借助cubegen来生成分子表面静电势值”。手册上写的调用cubegen是在gaussian里面吗?gaussian软件的utilities基本上没有用过。不是很清楚手册上您写的命令应该怎么输入。...

是的,cubegen就在高斯的安装目录下。进入DOS,然后进高斯安装目录,然后输入手册里给出的那条cubegen命令就行了。然后cubegen就会把输入的文本文件里的坐标的每个点的静电势数据都算出来,然后让Multiwfn读取产生的这个文件就行了
4楼2014-09-04 00:30:32
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panger

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sobereva at 2014-09-04 00:30:32
是的,cubegen就在高斯的安装目录下。进入DOS,然后进高斯安装目录,然后输入手册里给出的那条cubegen命令就行了。然后cubegen就会把输入的文本文件里的坐标的每个点的静电势数据都算出来,然后让Multiwfn读取产生 ...

现在我做的体系大概有110个原子左右,其中大概含有15个过渡金属(Pd),利用Multiwfn载入wfn文件能够完美的做各种分析,结果也非常好。现在尝试用您跟我说的利用cubegen来生成分子表面静电势值的方法分析时出了点小问题。对于小分子我试过了。利用cubgen也能完美解决,但是对于我的含催化剂体系,在载入.fch文件以后,程序会闪退?我也尝试过30个原子以内的催化剂,结果仍然是闪退。为什么.wfn文件没有任何问题,而.fch文件就会出问题呢?你觉得可能是哪里出错了。谢谢。
5楼2014-09-04 11:22:27
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

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引用回帖:
5楼: Originally posted by panger at 2014-09-04 11:22:27
现在我做的体系大概有110个原子左右,其中大概含有15个过渡金属(Pd),利用Multiwfn载入wfn文件能够完美的做各种分析,结果也非常好。现在尝试用您跟我说的利用cubegen来生成分子表面静电势值的方法分析时出了点小问 ...

可以把你的高斯输入、输出文件和fch文件都发给我(sobereva@sina.com),我看看
6楼2014-09-04 12:01:31
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不美女纸2017

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by panger at 2014-09-04 11:22:27
现在我做的体系大概有110个原子左右,其中大概含有15个过渡金属(Pd),利用Multiwfn载入wfn文件能够完美的做各种分析,结果也非常好。现在尝试用您跟我说的利用cubegen来生成分子表面静电势值的方法分析时出了点小问 ...

你好,请问当时您出现的闪退问题是如何解决的呢?
7楼2018-10-22 16:20:49
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