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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 我想问一下用NAMD软件计算的虫友们，你们的力场参数文件是怎么弄得？
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smutao

禁虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
本帖内容被屏蔽
11楼2014-09-30 04:06:50
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blacksep

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by gn02530640 at 2014-08-26 17:30:09
http://mackerell.umaryland.edu/charmm_ff.shtml

这里有其他力场可以下载，适用范围要看文献。

如果是要一些关于小分子的力场参数，个人目前是从 swissparam 和 paramchem 来做。

http://www.swissparam. ...

你好，请问下载了新的力场后，是怎么导入NAMD的？或者要存放在那个文件目录中呢？谢谢
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12楼2015-08-20 10:59:46
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红颜不美

金虫 (正式写手)
引用回帖:
12楼: Originally posted by blacksep at 2015-08-20 10:59:46
你好，请问下载了新的力场后，是怎么导入NAMD的？或者要存放在那个文件目录中呢？谢谢...

配置文件 参数力场改成你下的新力场就行
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计算模拟biubiu
13楼2015-08-20 11:22:53
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yylcx

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
。。。想去NAMD官网上学习下这个FFTK的插件，发现最近这个官网总是上不去，郁闷 了
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14楼2015-10-08 14:09:24
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红颜不美

金虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by yylcx at 2015-10-08 14:09:24
。。。想去NAMD官网上学习下这个FFTK的插件，发现最近这个官网总是上不去，郁闷 了

最近没上过官网
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计算模拟biubiu
15楼2015-10-08 16:42:11
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