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zhoujk0520木虫 (正式写手)
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[求助]
求助谁用过QIIME分析Miseq数据？跪求帮助 已有1人参与
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学习环境微生物，最近研究QIIME分析。按着官网上的流程和官网提供的454与Illumina的Example跑了一遍数据都没有问题。 可是现在有个问题。手头有个Illumina的Example的数据，Fastq格式，这个与官网上的数据不大一样，没有Mapping File。对于Miseq测序的最终生成结果我不是特别了解。请问最终生成的数据应该是仅仅只有一个Fastq文件么，没有 一个能包含Barcode信息和Primer信息的Mapping File么？ 如果这样的话，仅有一个Fastq文件（Fastq包含了碱基和质量分数文件以及Barcode），可是这样的话，官网流程上的check mapping File这一步就不用了吧，而且接下来的 Split library这一步又怎么进行呢？ Fastq的去杂和拼接又该怎么进行呢？ 求助各位大神！这个问题困扰了几天，没有解决很是着急。这肯定跟我自己的基础理论知识不够全面有关，可是在摸索QIIME的路上一个人确实是有点力不从心。希望各位大神能给予指点 谢谢谢谢！！ |
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