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求助：引物设计好了，OD怎么算的要加入多少水？
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| 我的引物是：CAGGCCTAACACATGCAAGTC, 现在有1个OD，请教该怎么计算该加入多少水？还请高手指教，在此先谢谢了！ |
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reasonspare(金币+3,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
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1． Oligo DNA是以OD260单位来计算的，这是指在1ml体积1cm光程标准比色皿中，260nm波长下吸光度为1A260的Oligo溶液定义为1 OD260单位，根据此定义，1 OD260单位相当于33μg的Oligo DNA，您可以根据此数据和您的Oligo DNA分子量，计算得到摩尔数以计算不同摩尔浓度的溶液。 2． 引物序列的分子量计算公式如下： MW=（A碱基数×312）+（C碱基数×288）+（G碱基数×328）+（T碱基数×303）-61 例如：引物TGGGCGGCGGTTGGTGTTACG A=1 C=3 G=11 T=6 MW=（1×312）+（3×328）+（6×303）-61=6541 3． Oligo DNA的分子量也可以用以下近似方法计算：Oligo DNA中的每个脱氧核苷酸碱基的平均分子量近似为324.5，则一条Oligo DNA的分子量=碱基数×324.5。 例：您得到一管标为5 OD260的20 mer Oligo DNA 分子量=20×324.5=6490 质量数=5×33=165μg 摩尔数=165/6490=0.025μmol=25nmol 若加灭菌双蒸水400μl溶解，则浓度为25nmol/400μl=62.5μM 4． 装有引物的eppendorf管一般保存于-20℃，临用前稀释。 5． 由于Oligo DNA呈很轻的干膜状附在管壁上，打开时极易散失，所以打开管子前请先离心10,000rpm，1min，然后再慢慢打开管盖。 6． 在装有引物的eppendorf管内加入100-500μl双蒸水，盖上管盖，充分上下振荡5-10分钟，再次离心10,000rpm，1min。 7． 计算原引物管primer的浓度（必要时测OD260核对厂家提供引物量是否正确）。 8． 计算并将应用primer稀释为10pmol/μl。 9． 标明原引物管、应用引物管、稀释方法，置-20℃保存。 比较复杂 简单的方法是电话询问引物合成公司 直接问明如何配制 |
2楼2008-04-10 22:02:17
3楼2008-04-11 07:34:40