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Dmol3 中经行周期性结构TS过程， Vibrational Analysis中出现可虚频但是没有强度值 已有1人参与
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如题：小弟利用Dmol3 模块进行周期性分子筛结构下的催化反应TS search 过程，经过40几个小时的计算，算出来了过渡态，之后再 Vibrational Analysis中出现了2个虚频(-264和-25)其他的都不是虚频，但是没有对应的强度值(Intensity)，自己琢磨的很久，不知道哪里出现了问题，想请教坛里的大神这方面的经验。下面是我的两张图： 该数据应楼主要求删除。 [ Last edited by franch on 2014-8-12 at 15:46 ] |
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:41:45
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:41:45
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Dmol3是把非周期性体系当做气态分子处理，吉布斯能包含了Translational, rotational, vibrational 及ZPE的贡献。 而对于周期性体系（即使你把气体分子放入周期性盒子），Dmol3是当成固态来处理，所以吉布斯能只包括了vibrational 及ZPE的贡献。 对于同一分子，两种模型算出来的吉布斯能当然不一样。 那个帖子的论文，没有这种方法算。而是设置DFT在0K下的总能为参考态，H和S的变化取实验值。 |
9楼2014-08-10 19:24:57
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4楼2014-08-10 14:53:05
