应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » Dmol3 中经行周期性结构TS过程， Vibrational Analysis中出现可虚频但是没有强度值
53/1返回列表
查看: 2148  |  回复: 30
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lingtao

银虫 (正式写手)

[求助] Dmol3 中经行周期性结构TS过程， Vibrational Analysis中出现可虚频但是没有强度值 已有1人参与

如题：小弟利用Dmol3 模块进行周期性分子筛结构下的催化反应TS search 过程，经过40几个小时的计算，算出来了过渡态，之后再 Vibrational Analysis中出现了2个虚频(-264和-25)其他的都不是虚频，但是没有对应的强度值(Intensity)，自己琢磨的很久，不知道哪里出现了问题，想请教坛里的大神这方面的经验。下面是我的两张图：

该数据应楼主要求删除。

[ Last edited by franch on 2014-8-12 at 15:46 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2014-08-09 15:48:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huxiao.gl

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:47:27
引用回帖:
23楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-08-10 22:48:52
看样子仅仅只是ZPE的问题记错了，Freq我算了个稍大些的分子，PBC下的振动模式就多了几个。...

振动模式多几个，是因为固体振动频率的个数本来就和气体不一样！
固体是3N-3，而非直线分子是3N-6。
你看是不是只多出3个频率嘛
赞一下 回复此楼
good luck
25楼2014-08-10 23:06:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 31 个回答

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★ ★
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:38:54
要对TS的构型计算了频率才有频率的强度。你可以在得到的构型上计算能量及性质中的频率。

另外表面体系dmol3计算频率尤其小心，仅可作为参考，零点能及热化学性质不具备明确，一般也不会按照这样的方式来处理。做个过渡态确定还是很有必要的。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-08-10 11:48:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingtao

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-08-10 11:48:11
要对TS的构型计算了频率才有频率的强度。你可以在得到的构型上计算能量及性质中的频率。

另外表面体系dmol3计算频率尤其小心，仅可作为参考，零点能及热化学性质不具备明确，一般也不会按照这样的方式来处理。做 ...

你好，先谢谢你了，我在搜索过渡态的时候，已经勾选上了Frequence这一项了，我的构型是附件这样的。想请问你一下，搜索过渡态的时候，频率的强度值是不是不重要？有虚频的存在就行了吧？因为我找到虚频了
Dmol3 中经行周期性结构TS过程， Vibrational Analysis中出现可虚频但是没有强度值
计算参数3.png


Dmol3 中经行周期性结构TS过程， Vibrational Analysis中出现可虚频但是没有强度值-1
过渡态文件.png
赞一下 回复此楼
3楼2014-08-10 12:03:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:40:52
lingtao(franch代发): 金币+5, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:50:30
引用回帖:
3楼: Originally posted by lingtao at 2014-08-10 12:03:51
你好，先谢谢你了，我在搜索过渡态的时候，已经勾选上了Frequence这一项了，我的构型是附件这样的。想请问你一下，搜索过渡态的时候，频率的强度值是不是不重要？有虚频的存在就行了吧？因为我找到虚频了

计算参数 ...

强度没那么重要，但正确的过渡态应该只有一个虚频。你这有两个。这种情况只能试试做个过渡态的优化。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-08-10 14:53:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 31 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[文学芳草园] 梦想 +4 myrtle 2026-08-26 4/200 2026-08-31 08:43 by 逸域隐帆
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗？ +6 349506619 2026-08-28 6/300 2026-08-31 08:43 by kingkocxr
[基金申请] 基金不中，共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已，这评审意见是按照杰青的条件评的吧？ +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +12 Kittylucky 2026-08-27 13/650 2026-08-29 00:04 by superceng
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合现在查不到了吗？ +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭