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Dmol3 中经行周期性结构TS过程， Vibrational Analysis中出现可虚频但是没有强度值 已有1人参与
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如题：小弟利用Dmol3 模块进行周期性分子筛结构下的催化反应TS search 过程，经过40几个小时的计算，算出来了过渡态，之后再 Vibrational Analysis中出现了2个虚频(-264和-25)其他的都不是虚频，但是没有对应的强度值(Intensity)，自己琢磨的很久，不知道哪里出现了问题，想请教坛里的大神这方面的经验。下面是我的两张图： 该数据应楼主要求删除。 [ Last edited by franch on 2014-8-12 at 15:46 ] |
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lingtao(franch代发): 金币+10, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:44:10
lingtao(franch代发): 金币+10, 谢谢回帖交流。。。 2014-08-11 17:44:10
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不好意思，回复晚了，刚刚在路上骑车。。 这个问题在图形界面下实现不了。首先先在Dmol3 Calculation下面save files，生成的文件有个input的文件，然后添入下面两行： Opt_Coordinate_System cartesian Opt_GDIIS on 保存后点开Dmol3 Calculation的对话框，然后run files。 这里有几点做适当解释，首先，因为前面的讨论的问题，因为freq计算的不一定靠谱，所以优化得到的结果是否靠谱我不敢保证。其次，Opt_Coordinate_System 的作用是这样的，因为GDIIS的方法只能适用于直角坐标，因此才有这个选项。另外，GDIIS对于这样的优化是否完全有改善，这点我不完全确定。 |
16楼2014-08-10 20:49:29
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4楼2014-08-10 14:53:05