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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Wien2k&FLAPW&ELK » 关于wien2k软件安装和配置问题请教各位高手！
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letianhan

木虫 (著名写手)

[求助] 关于wien2k软件安装和配置问题请教各位高手！

单机配置：i5-4570 处理器一个 (四核四线程)，8G内存，集成显卡，不联网，只有本人自己使用。
想用wien2k 来研究材料的掺杂问题，处理的体系在100个原子左右。
关于安装和软件编译有以下几个问题搞不清楚：

1.  台式机的系统目前是Ubuntu 12.04 个人桌面版，是否可以顺利安装wien2k？非得要改成服务器正式版吗？？若要改的话，如何操作可将Ubuntu 12.04  个人桌面版换成服务器正式版 ？请有经验的高手告之。

2.  关于串行计算？还是k点并行？还是mpi并行？WIEN2k- hardware/software官方指南2013年有如下资料：
 Intel I7 quad (six)-core processors with fast memory bus (1.5-3Gb/core, Gbit-network, SATA disks).
with a few such PCs you have a quite powerful cluster (k-parallel)
60 - 100 atom / cell, requires 2-4 Gb RAM
k-point Parallelization：
mpi-parallelization：for bigger cases (> 50 atoms) and more than 4 cores
我想研究的体系大于50个原子，请问单机（一个cpu，4core+8G）是串行计算还是并行计算，若是并行，是k并行还是mpi并行？考虑到计算效率。

3.  软件编译里面有：configure Parallel execution
Shared Memory Architecture? (y/n):请问这个是什么意思？单机里面有两个或多个cpu算是这种结构吗？？本人的单机只有一颗，那这里应该是n？
Remote shell (default is ssh) =
Do you have MPI and Scalapack installed and intend to run
finegrained parallel? (This is usefull only for BIG cases)!
(y/n)
从这可以看出，单机是不需要远程登录的？考虑到计算效率的话，单机是否也可本地登录？
4.  若确定是并行计算，考虑到本人的具体配置，请问.machines 文件如何书写？

请各位高手不吝赐教！
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letianhan

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1楼 2014-08-06 18:16:13
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letianhan

木虫 (著名写手)
送红花一朵
都看过这些帖子。硬件不同，以前的台式就一个单核的cpu，我装成功过，是串行计算。现在的cpu是多核的，我就不清楚还是串行计算，但cpu是否完全工作，效率高低如何不清楚。单机多核的cup可否用于并行，并行与串行的计算效率高低比较如何？很多帖子都是关于cluster的安装，这里我的是单机，与之不同。
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2楼2014-08-06 19:23:37
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
2楼: Originally posted by letianhan at 2014-08-06 19:23:37
都看过这些帖子。硬件不同，以前的台式就一个单核的cpu，我装成功过，是串行计算。现在的cpu是多核的，我就不清楚还是串行计算，但cpu是否完全工作，效率高低如何不清楚。单机多核的cup可否用于并行，并行与串行的计 ...

gnu的编译器我没尝试过，ubuntu采用ifort倒是比较麻烦，需要修改shell，但可以尝试一下。以前在自己RHEL系统服务器上编译成功了。编译WIEN2K不要用FFTW3，我自己用的是2.1.5的，目前版本的WIEN2K我情况不明。安装过程每一步都有提示，应该比较简单，如果要多核心并行，MPI部分的选项为y。
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letianhan
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-08-06 20:03:55
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letianhan

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-08-06 20:03:55
gnu的编译器我没尝试过，ubuntu采用ifort倒是比较麻烦，需要修改shell，但可以尝试一下。以前在自己RHEL系统服务器上编译成功了。编译WIEN2K不要用FFTW3，我自己用的是2.1.5的，目前版本的WIEN2K我情况不明。安装过 ...

请问你的服务器是单机运行吗？还是连着很多个计算节点？对于安装wien2k，多核心的单机单cpu的机子是可以并行吗？还是不能并行？谢谢！！
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4楼2014-08-06 20:12:04
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
4楼: Originally posted by letianhan at 2014-08-06 20:12:04
请问你的服务器是单机运行吗？还是连着很多个计算节点？对于安装wien2k，多核心的单机单cpu的机子是可以并行吗？还是不能并行？谢谢！！...

我自己的小服务器，单机的。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
5楼2014-08-06 20:41:45
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
letianhan: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-08-06 21:07:20
letianhan: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2014-08-08 15:14:59
1. 可以装，不用换系统。
2 k点并行即可。
3 这种并行和CPU数没有关系，看核数就可以了。Shared Memory是所有处理器使用同一片内存，单机是y。远程登录无可见性能损失。
4 节点名写localhost，其他照范例即可。
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letianhan
6楼2014-08-06 20:50:35
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letianhan

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-08-06 20:50:35
1. 可以装，不用换系统。
2 k点并行即可。
3 这种并行和CPU数没有关系，看核数就可以了。Shared Memory是所有处理器使用同一片内存，单机是y。远程登录无可见性能损失。
4 节点名写localhost，其他照范例即可。

第二点 K点并行即可。若处理体系在100个原子左右的话，K点并行与mpi并行的区别在哪里？从计算效率看的话，选哪种计算好些？官方指出对大于50个原子的体系建议mpi并行，不过硬件可能是集群。考虑的单机，mpi并行是不是没有必要？对于同一个体系（假设100个原子），单机k并行和单机mpi并行，所花时间是不是差不多？还是差很多？哪种快些？谢谢！
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7楼2014-08-06 21:13:47
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letianhan

木虫 (著名写手)
我以前在单核cpu的单机上装成功过wien2k，用的是串行计算。
现在硬件升级后，多核cpu用串行配置的话，是不是工作时只启动一个核，其余的核不工作？还是所有的核也工作，毕竟是单机，不是集群。请问是这样吗？？
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8楼2014-08-07 08:36:23
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letianhan

木虫 (著名写手)
官网上面的资料：（参考cpu： i7-3930K是六核12线程的）

Serial benchmark: NMAT=3481, complex
Intel Core i7-3930K 3.20GHz       36 sec    composerxe-2013.4.183 (1 job with 1 thread)
Intel Core i7-3930K 3.20GHz       23 sec    composerxe-203.4.1831 (1 job with 2 thread)
Intel Core i7-3930K 3.20GHz       16 sec    composerxe-2013.4.183 (1 job with 4 thread)
Intel Core i7-3930K 3.20GHz       14 sec    composerxe-2013.4.183 (1 job with 6 thread)

Serial benchmark with parallel jobs (Tests the "real" performance under full load with a "k-parallel" job): NMAT=3481, complex

Intel Core i7-3930K 3.20GHz    composerxe-2013.4.183 (1 thread)
1 job: 37 sec;    2 jobs: 38 sec;   4 jobs: 47 sec;   6 jobs: 49 sec

Intel Core i7-3930K 3.20GHz    composerxe-2013.4.183 (2 threads)
1 job: 23 sec;    3 jobs: 39 sec;   6 jobs: 50 sec      
  
看以上数据的话，单cpu i7-3930K串行和并行都可以？串行计算数据里面Intel Core i7-3930K 3.20GHz       14 sec    composerxe-2013.4.183 (1 job with 6 thread)
是如何实现的？只要设置成串行就可以啦吗？？
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9楼2014-08-07 11:13:09
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