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xiaofeiyu0

木虫 (正式写手)

[求助] Wien2k运算过程lapw1总是出现错误 已有1人参与

这个问题困扰了我很久很久。希望各位朋友能帮我解答一下。
我用服务器计算任务。结构简单的任务能够计算成功,但稍微复杂的就无法运算。
例如:Mg2Si   从MS直接导出优化的结构,初始化很顺利。
但 改变 Mg2Si  晶格参数 使得a=b≠c , 就会出现 lapw1错误。同样的结构,我用台式电脑直接运算,是可以计算成功的。现在很疑惑,如果节点安装有问题为什么,有些结构可以计算,有些结构却不行。
提交脚本计算,结构只提示lapw1 error 没有其他内容。
下面是我用管理节点直接run_lapw出现下例提示
[aa@cluster 0.08]$ run_lapw
LAPW0 END
*** glibc detected *** /local/wien2k/lapw1c: corrupted double-linked list: 0x000000000100ae00 ***
======= Backtrace: =========
/lib64/libc.so.6[0x3469a75366]
/lib64/libc.so.6[0x3469a78181]
/local/wien2k/lapw1c[0x4a854c]
/local/wien2k/lapw1c[0x464aad]
/local/wien2k/lapw1c[0x4105ef]
/local/wien2k/lapw1c[0x43e94d]
/local/wien2k/lapw1c[0x40498c]
/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xfd)[0x3469a1ecdd]
/local/wien2k/lapw1c[0x404889]
======= Memory map: ========
00400000-00589000 r-xp 00000000 08:21 6435302                            /local/wien2k/lapw1c
00789000-00794000 rw-p 00189000 08:21 6435302                            /local/wien2k/lapw1c
00794000-00a1d000 rw-p 00000000 00:00 0
00d73000-016d8000 rw-p 00000000 00:00 0                                  [heap]
3469600000-3469620000 r-xp 00000000 08:21 1573288                        /lib64/ld-2.12.so
346981f000-3469820000 r--p 0001f000 08:21 1573288                        /lib64/ld-2.12.so
3469820000-3469821000 rw-p 00020000 08:21 1573288                        /lib64/ld-2.12.so
3469821000-3469822000 rw-p 00000000 00:00 0。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
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尽自己最大的力!
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaofeiyu0: 金币+5, ★有帮助 2014-01-23 09:35:40
改变对称性以后是否进行过init_lapw?init_lapw有没有什么提示?
2楼2014-01-18 23:43:17
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xiaofeiyu0

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-01-18 23:43:17
改变对称性以后是否进行过init_lapw?init_lapw有没有什么提示?

请问如何改变对称性?a=b≠c的对称性为P1
尽自己最大的力!
3楼2014-01-19 19:51:28
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2014-01-20 07:44:00
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaofeiyu0 at 2014-01-19 19:51:28
请问如何改变对称性?a=b≠c的对称性为P1...

WIEN2K产生的struct文件头两行是是什么?
4楼2014-01-20 06:34:41
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xiaofeiyu0

木虫 (正式写手)

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2014-01-20 22:01:55
引用回帖:
4楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-01-20 06:34:41
WIEN2K产生的struct文件头两行是是什么?...

呵呵 我原结构是p1的对称性,init_lapw 后set Automatically RMT之后 会出现“ WARNING: Mult not equal. PLEASE CHECK outputnn-file
WARNING: ityp not equal. PLEASE CHECK outputnn-file”。初始化设置nn 后出现一个新结构文件**.struct_nn,这里的对称性是变化的。但想算的是p1结构 所以使用old case.struct 继续初始化的。
对于你说的修改对称性,我不知道修改成什么对称性。我本身需要的就是p1结构。
尽自己最大的力!
5楼2014-01-20 10:12:12
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaofeiyu0 at 2014-01-20 10:12:12
呵呵 我原结构是p1的对称性,init_lapw 后set Automatically RMT之后 会出现“ WARNING: Mult not equal. PLEASE CHECK outputnn-file
WARNING: ityp not equal. PLEASE CHECK outputnn-file”。初始化设置nn 后 ...

恩,就是这一步,建议你先使用WIEN2k生成的struct来试试计算。

Material Studio比较愚蠢,实际上改变一个晶胞长度一般是不会让对称性直接掉到降到P1的,很有可能你的结构并不是真的P1,WIEN2k生成的对称性才是你需要的。
6楼2014-01-21 01:26:51
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xiaofeiyu0

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by KalaShayminS at 2014-01-21 01:26:51
恩,就是这一步,建议你先使用WIEN2k生成的struct来试试计算。

Material Studio比较愚蠢,实际上改变一个晶胞长度一般是不会让对称性直接掉到降到P1的,很有可能你的结构并不是真的P1,WIEN2k生成的对称性才是你 ...

正常有对称性的变成P1结构也应该是给运算的。
尽自己最大的力!
7楼2014-01-23 09:32:14
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xiaofeiyu0

木虫 (正式写手)

问题 基本解决了,主要是节点的库函数有问题,把别的机子上的库函数拷贝到服务器上,重新编译就可以计算了。工程师帮我弄了很久解决这个问题。

非常感谢KalaShayminS的帮助。
尽自己最大的力!
8楼2014-01-23 09:35:10
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