应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 有引物序列，却找不到对应的目的序列
152/2返回列表上一页12
查看: 3715  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chenyanzhen

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-04 20:58:57
因为不知道你的找的是什么基因/RNA，所以就只选择了上述各个结果，都是与Karenia mikimotoi相关的。

是的，我现在在做米氏凯伦藻，想要做RT-PCR，想直接从文献中得到引物探针然后去合成，但是我得知道这对引物合成的目的序列有多长，以便后续实验。在BLAST中，我只能在相应的序列中找到上游或者下游引物，暂时没找到都包含上下游引物的，你上面列的好像也是只有一条吧？
赞一下 回复此楼
活在当下，充实自己
11楼2014-08-05 09:05:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chenyanzhen: 金币+12, ★★★很有帮助 2014-08-07 11:21:40
在文献中看到一对引物序列，如何知道该对引物扩增产物的大小及序列？方法如下：
1.打开blastn页面，在输入框中依次输入上游引物序列、50-150个n、下游引物的反向互补序列，在下面organism框中输入物种拉丁名。
有引物序列，却找不到对应的目的序列
2.在下面program selection选项中选择Somewhat similar sequences (blastn)项。
有引物序列，却找不到对应的目的序列-1
3.点击blast，结果出来后，查看两边粗黑线、中间有灰色细线连接的比对结果，如下图中红框中所示。
有引物序列，却找不到对应的目的序列-2
4.根据比对结果即可知道该对引物扩增的基因名称、序列及产物大小。如该例中所示：扩增产物为 large subunit ribosomal RNA gene的一段，大小为800-578+1=223bp
有引物序列，却找不到对应的目的序列-3
赞一下(3人) 回复此楼
12楼2014-08-05 22:21:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

八斤公主狗

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by stone2239 at 2014-08-05 22:21:20
在文献中看到一对引物序列，如何知道该对引物扩增产物的大小及序列？方法如下：
1.打开blastn页面，在输入框中依次输入上游引物序列、50-150个n、下游引物的反向互补序列，在下面organism框中输入物种拉丁名。

...

怎么按照这个方法没找到呢

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
13楼2017-02-21 11:00:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

八斤公主狗

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
12楼: Originally posted by stone2239 at 2014-08-05 22:21:20
在文献中看到一对引物序列，如何知道该对引物扩增产物的大小及序列？方法如下：
1.打开blastn页面，在输入框中依次输入上游引物序列、50-150个n、下游引物的反向互补序列，在下面organism框中输入物种拉丁名。

...

怎么按照这个方法没找到呢

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
14楼2017-02-21 11:00:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

花城殿

禁虫
本帖内容被屏蔽
15楼2022-07-16 15:58:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chenyanzhen 的主题更新
152/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 明天E口面上会评 +4 布布和一二 2026-07-12 5/250 2026-07-13 10:44 by zzybjr
[公派出国] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 obzynn3tuv 2026-07-11 4/200 2026-07-13 10:35 by emlgkvoijw
[考博] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 obzynn3tuv 2026-07-11 4/200 2026-07-13 10:25 by emlgkvoijw
[论文投稿] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 obzynn3tuv 2026-07-11 4/200 2026-07-13 10:15 by emlgkvoijw
[硕博家园] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 obzynn3tuv 2026-07-11 3/150 2026-07-13 09:56 by emlgkvoijw
[硕博家园] 大龄残疾硕士的一点执念 +17 3776737374 2026-07-06 27/1350 2026-07-13 06:05 by 鲁弥abc
[考博] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 obzynn3tuv 2026-07-11 4/200 2026-07-13 00:24 by v2i90kmrcu
[考研] 售T0P一区SCI文章，我:8O5.51.O.54,科目齐全,可＋急 +3 obzynn3tuv 2026-07-11 4/200 2026-07-13 00:15 by v2i90kmrcu
[基金申请] 不要再数国自然申请书的 filecode 的分隔符个数了 +10 sadpencil 2026-07-12 15/750 2026-07-12 21:50 by sadpencil
[基金申请] 祈祷青基必中 50+6 hadengry 2026-07-09 16/800 2026-07-12 20:31 by 登山虫虫
[基金申请] 生命口会评 +11 wuke100666 2026-07-07 12/600 2026-07-11 19:30 by hhs666
[基金申请] 关于如何从代码看上不上会 +17 且听虎啸 2026-07-09 23/1150 2026-07-10 19:51 by sdfapple719
[有机交流] chemdraw 20+5 ?慕鱼? 2026-07-08 6/300 2026-07-10 15:37 by 紫枫星域
[基金申请] b口会评 +6 当空照 2026-07-08 6/300 2026-07-09 20:49 by tonyliu0401
[基金申请] 信息学部会评时间 +3 xuel2011 2026-07-06 3/150 2026-07-09 19:05 by mollyzhang_2003
[考研] 在职考研 +6 wu5d 2026-07-08 7/350 2026-07-09 16:40 by 化工小霸王呀
[论文投稿] MSER送审了还被拒稿 +3 S778950906 2026-07-08 5/250 2026-07-09 15:46 by S778950906
[有机交流] 硝基还原 20+3 暮年飞雪 2026-07-07 5/250 2026-07-09 13:30 by tfang
[基金申请] 化学口会评？应用基础研究和基础研究，希望能分开 +3 Tide man 2026-07-08 3/150 2026-07-09 11:36 by dede5556
[有机交流] Suzuki偶联中硼酸酯原料掉下的硼酸酯是否可以自身偶联，生成B2Pin2杂质 500+3 天下大同 2026-07-06 3/150 2026-07-07 10:31 by martyr_oyx
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭