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转录组测序后,与NCBI上提供的参考基因组mapping率极低的问题
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gegenting
新虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
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帖子: 35
在线: 16小时
虫号: 5430121
注册: 2017-01-01
专业: 细胞周期与调控
引用回帖:
10楼
:
Originally posted by
园园补补
at 2015-03-23 21:45:03
二三十左右,之后追加了这个菌株的基因组,直接用自己的基因组做参考,mapping率一下子高到九十几。。。这是我的血泪史
...
能请教一下,mapping率是什么意思么?
发自小木虫IOS客户端
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11楼
2017-04-26 11:52:42
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阳阳阳888
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(幼儿园)
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虫号: 13922598
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专业: 果树学
【答案】应助回帖
您好,我是测的苹果的转录组和NCBI上现有的基因组mapping50-80的都有,公司说mapping达到90以上才能做,这是什么原因呢?有可能是我取样的问题吗?还是公司的问题,不懂生信也没法质问公司啊,谢谢。
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12楼
2020-02-02 14:36:34
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