| 查看: 2078 | 回复: 1 | ||
[求助]
请教maxquant 搜出5000多个蛋白,如何计算其中膜蛋白的比例?
|
|
请教各位大虾, 小弟在做人细胞的全蛋白组学鉴定。maxquant 搜出500多个蛋白,想知道其中膜蛋白的比例,有什么数据库可以算得?不需要5000个蛋白一个个比对的。 maxquant 搜出得数据格式举例如下: Protein IDs Majority protein IDs Peptide counts (all) Peptide counts (razor+unique) Peptide counts (unique) Protein names Gene names Fasta headers Proteins Peptides Razor + unique peptides Unique peptides Sequence coverage [%] Unique + razor sequence coverage [%] Unique sequence coverage [%] Mol. weight [kDa] Sequence length Sequence lengths A0AV56;B7ZLP6;Q15424;Q15424-2;F5GZU3;B7Z2F6;K7EII0;K7ES42 A0AV56;B7ZLP6;Q15424;Q15424-2;F5GZU3;B7Z2F6 27;27;27;25;23;22;4;3 27;27;27;25;23;22;4;3 15;15;15;13;11;10;3;3 Scaffold attachment factor B1 SAFB * 8 27 27 15 31 31 18.1 102.85 917 917;916;915;848;747;759;153;106 专家、大虾们们有谁知道具体怎么怎么搜膜蛋白的比例? |
» 猜你喜欢
面上项目filecode邪修
已经有6人回复
应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键
已经有14人回复
2026国自然放榜时间
已经有4人回复
关于代码变化问题,想知道的进来
已经有22人回复
这样的filecode谁见过
已经有21人回复
filecode与中标关系的预测
已经有5人回复
fileCode有新解读?
已经有18人回复
关于filecode,很负责任的告诉大家
已经有7人回复
【2027博士申请】纳米药物递送方向
已经有5人回复
关于豆爷回答的JTJC与%2F数量
已经有7人回复
minganyang
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 831.1
- 红花: 2
- 帖子: 216
- 在线: 133.8小时
- 虫号: 1744305
- 注册: 2012-04-08
- 性别: GG
- 专业: 化学生物学与生物有机化学
2楼2015-11-13 21:23:12










回复此楼
20