应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 毕业献礼，送大家一个分析降解组数据的小程序
51/1返回列表
查看: 1277  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

XOooZzz

银虫 (小有名气)

[交流] 毕业献礼，送大家一个分析降解组数据的小程序 已有3人参与

本程序根据降解组数据筛选psRNATarget的预测结果。筛选的主要原则是：若某RNA位点被psRNATarget预测为miRNA的靶标，且预测位点上出现异常多的断裂事件（1个降解组数据视为一个断裂事件），则判断该位点为真正的miRNA靶位点。

本人太懒，没好好写程序文档...有兴趣又没看懂我写什么的请给我留言吧。

最后，本程序遵循GNU GENERAL PUBLIC LICENSE Version 2发布。毕业献礼，送大家一个分析降解组数据的小程序
未命名.PNG
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 降解组数据分析.7z
    • 2014-07-28 00:36:05, 1.15 M

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

yantaowang

» 猜你喜欢
1楼 2014-07-28 00:40:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

growlywolf

金虫 (小有名气)
赞。下下来玩一下
回复此楼
5楼2014-08-05 17:51:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

小松果2012

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-07-29 08:44:27
请问这个具体要怎么用呢？我们目前也是用一些软件预测miRNA，不过假阳性很多，想问一下：如果是针对SNP是否影响miRNA结合，能用你说的这个方法吗？
赞一下 回复此楼
2楼2014-07-28 17:59:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

XOooZzz

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小松果2012 at 2014-07-28 17:59:38
请问这个具体要怎么用呢？我们目前也是用一些软件预测miRNA，不过假阳性很多，想问一下：如果是针对SNP是否影响miRNA结合，能用你说的这个方法吗？

这个程序只针对植物，动物我不保证效果哈。
然后要有降解组数据。

如果你符合上述条件，可以看看压缩包里面的说明文档看看怎么用。

但即使这个程序的结果符合你的预期，也只是间接的证据，你还是要做实验来进一步验证。
赞一下 回复此楼
3楼2014-07-28 18:58:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小松果2012

银虫 (正式写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-07-29 08:44:31
引用回帖:
3楼: Originally posted by XOooZzz at 2014-07-28 18:58:59
这个程序只针对植物，动物我不保证效果哈。
然后要有降解组数据。

如果你符合上述条件，可以看看压缩包里面的说明文档看看怎么用。

但即使这个程序的结果符合你的预期，也只是间接的证据，你还是要做实验来 ...

谢谢哈，我们是做人类遗传的，后来我百度psRNATarget才知道这个是针对植物的。
赞一下 回复此楼
4楼2014-07-28 23:35:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 04:33 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 基金不中，共勉 +5 eulota 2026-08-26 5/250 2026-08-26 23:33 by young90
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 今天务委会开完了，明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭