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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 链霉菌鉴定
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summit061800

新虫 (初入文坛)

[求助] 链霉菌鉴定 已有3人参与

用特异性引物pcr，鉴定链霉菌种类，菌落外观形态和菌丝形态完全不同的几个菌株，竟都可以扩增出特异性条带，这是为什么呀？ps：引物引自别人的文献，不是自己设计的

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1楼 2014-07-27 20:29:20
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499649610

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一般 先确定是哪个属，然后选取看家基因构建进化树，判断亲缘关系会比较好，建议至少选择五个看家基因同时进行多位点序列分析。
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8楼2014-07-28 17:06:22
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liuboeo

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
建议测ITS，你那样做不是很可靠，你做的菌株和文献里一样么

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2楼2014-07-27 21:40:57
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summit061800

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuboeo at 2014-07-27 21:40:57
建议测ITS，你那样做不是很可靠，你做的菌株和文献里一样么

我是自己分离的菌株，引用文献中的几对引物逐一做pcr,鉴定菌株到底是哪个种。

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3楼2014-07-27 22:12:27
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liuboeo

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by summit061800 at 2014-07-27 22:12:27
我是自己分离的菌株，引用文献中的几对引物逐一做pcr,鉴定菌株到底是哪个种。
...

你是想只通过pcr不测序来鉴定菌种么？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2014-07-27 22:31:42
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