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summit061800

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 221
帖子: 34
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虫号: 3052305
注册: 2014-03-14
专业: 病原细菌与放线菌生物学

[求助] 链霉菌鉴定已有3人参与

用特异性引物pcr，鉴定链霉菌种类，菌落外观形态和菌丝形态完全不同的几个菌株，竟都可以扩增出特异性条带，这是为什么呀？ps：引物引自别人的文献，不是自己设计的

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1楼 2014-07-27 20:29:20

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

liuboeo

新虫 (小有名气)

应助: 12 (小学生)
金币: 1091.3
帖子: 161
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虫号: 2390057
注册: 2013-03-31
性别: GG
专业: 微生物生理与生物化学

【答案】应助回帖

引用回帖:

5楼: Originally posted by summit061800 at 2014-07-27 22:45:13
嗯，是的
...

这样做是不可靠的，首先简单通过形态并不能准确判断种属，你如果先假定它是某个种，然后再用相关文献里报道的特异性引物去pcr来确定种属，这个思路本身就是不严谨的，也是事倍功半的，相同种的不同株基因组dna都有差异，何况这些菌都是你筛选出来的，另外你这样做很容易受到别人实验结果的影响，他的特异性片段确定只在这个种里才有吗？不能确定的话这个方法就不能用的，鉴定真核微生物一般是测ITS序列，可以先用通用引物，这段序列比较保守，同种差异不大，序列测出后在ncbi里面blast，会有相似度由高到低的结果，想更确定判断可以做进化树

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