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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » 表观遗传学实验——染色质免疫沉淀相关问题？
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w1602928049
11楼2015-01-11 11:12:11
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totoro626

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
10楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2015-01-11 02:04:13
那要对B基因的调控顺序进行分析预测，看上面有哪些可能的response elements，也就是可能的转录因子结合位点或反应元件，在此基础上进行验证。验证步骤基本包括：
1、构建由B基因调控序列（启动子+增强子顺序）调控 ...

“要对B基因的调控顺序进行分析预测，看上面有哪些可能的response elements，也就是可能的转录因子结合位点或反应元件”
这个是通过生物信息学的方法进行预测再实验验证吗，感觉promoter的预测网站比较杂，有什么好的推荐吗，看文献都是已经有结果的验证过程，但看不到如何寻找可能有调控关系的a蛋白的思路啊，马上要做的实验就是相关内容，很担心没有结果应该如何寻找相关转录因子
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12楼2015-01-12 09:21:41
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader

【答案】应助回帖

引用回帖:
12楼: Originally posted by totoro626 at 2015-01-11 20:21:41
“要对B基因的调控顺序进行分析预测，看上面有哪些可能的response elements，也就是可能的转录因子结合位点或反应元件”
这个是通过生物信息学的方法进行预测再实验验证吗，感觉promoter的预测网站比较杂，有什么 ...

有许多网站或软件可以做这方面的事，有些可能不再免费了。你可以看看这些：
For transcription factor binding site prediction you can use these tools：
TRANSFEC (http://www.gene-regulation.com)- from Biobase - Not freely available
JASPER ((http://jaspar.genereg.net) - Open Access
Information of many other online tools is available on following link-
http://molbiol-tools.ca/Transcriptional_factors.htm
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13楼2015-01-12 10:30:07
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wl_1956

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-07-28 03:23:28
有关ChIP的问题已经有朋友问起。在另一个帖子中我做了具体的回答，建议楼主到这个帖子去可以下： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7701737&pid=8#pid8

以下是我刚刚进一步回答的一个问题，希望 ...

您好，打扰了，Chip可以用于核酸与蛋白质的研究吗
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14楼2018-06-30 14:03:10
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