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xiaoboy185

金虫 (正式写手)

[求助] siesta和dmol那个更快些

siesta和dmol两者都是基于原子基组的,大家能否比较下两者的运行速度,收敛性能等方面
多谢
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xiaoboy185

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-07-22 11:18:28
SIESTA快一些,因为是线性标度(O(N))的,但是几何优化maybe不靠谱,我老师的做法通常是把force和displacement输出到Gaussian的external来做的。程序是开源的,结果能够分析的方式比较多。收敛性我不确定,很少用S ...

感谢你的回复。
3楼2014-07-22 12:35:55
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-07-29 13:10:34
SIESTA快一些,因为是线性标度(O(N))的,但是几何优化maybe不靠谱,我老师的做法通常是把force和displacement输出到Gaussian的external来做的。程序是开源的,结果能够分析的方式比较多。收敛性我不确定,很少用SIESTA。
Dmol3不是线性标度的,但一些方法相对靠谱,只要计算的参数合理,很难收敛的也不多见。但是程序相对商业化,波函数文件是加密的,比如想要分析个ELF都是不可能的。

速度上来说,我们以前做的80原子体系在SIESTA上只需4核心的工作站就能轻松解决,Dmol3相对来说就没这么快了。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-07-22 11:18:28
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