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xiaoboy185金虫 (正式写手)
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[求助]
siesta和dmol那个更快些
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siesta和dmol两者都是基于原子基组的，大家能否比较下两者的运行速度，收敛性能等方面 多谢 |
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franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-07-29 13:10:34
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。 2014-07-29 13:10:34
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SIESTA快一些，因为是线性标度（O(N)）的，但是几何优化maybe不靠谱，我老师的做法通常是把force和displacement输出到Gaussian的external来做的。程序是开源的，结果能够分析的方式比较多。收敛性我不确定，很少用SIESTA。 Dmol3不是线性标度的，但一些方法相对靠谱，只要计算的参数合理，很难收敛的也不多见。但是程序相对商业化，波函数文件是加密的，比如想要分析个ELF都是不可能的。 速度上来说，我们以前做的80原子体系在SIESTA上只需4核心的工作站就能轻松解决，Dmol3相对来说就没这么快了。 |
2楼2014-07-22 11:18:28
xiaoboy185
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3楼2014-07-22 12:35:55
