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732749120

金虫 (初入文坛)

[求助] MD结果处理 已有1人参与

我用cp2k模拟了个醇和氧气在催化剂的作用下反应过程，即MD，输出文件只有.out和.xyz文件，请问结果如何分析，怎样能查看反应过程？
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1楼 2014-07-17 18:09:28
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
732749120(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流！ 2014-07-22 18:42:03
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
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我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
2楼2014-07-17 18:26:36
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732749120

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by magicmonk at 2014-07-17 18:26:36
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/

我是不是先将.xyz转化成一下，然后进行数据分析？你能给我详细的说一下嘛
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3楼2014-07-18 09:36:47
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magicmonk

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
732749120: 金币+5 2014-07-18 15:33:19
732749120(月只蓝代发): 金币+1, 鼓励交流！ 2014-07-22 18:42:10
引用回帖:
3楼: Originally posted by 732749120 at 2014-07-18 09:36:47
我是不是先将.xyz转化成一下，然后进行数据分析？你能给我详细的说一下嘛...

VMD是可以直接读xyz文件的，你看一下手册就好
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我们最深的恐惧不是我们能力不够，我们最深的恐惧是能力超越了极限。
4楼2014-07-18 11:49:46
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