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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 用Gaussian算有机共轭大分子时，怎样构建分子的共轭键？
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fujishima

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 用Gaussian算有机共轭大分子时，怎样构建分子的共轭键？ 已有5人参与

用Gaussian算有机共轭大分子时，我用chemdraw线画出分子，在转换成Gaussian输入文件。我想问的是chemdraw画图时，共轭分子的键怎样设置，或者是不是不用设置，请各位帮帮忙啊
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1楼 2014-07-09 21:25:59
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bittersmile

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
高斯输入只需要原子坐标。键只是我们虚构来理解化学的，不需要输入。
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2楼2014-07-09 21:51:15
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oinkmasta

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
同楼上，键在高斯中只是方便你观察分子的，计算方面没有键也可以。
当然，如你要调整构型，还是有键看得清楚。是我的话就直接在高斯里面画分子了，不会花太久的。
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16届本科在北美
3楼2014-07-09 22:42:47
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fujishima

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by bittersmile at 2014-07-09 21:51:15
高斯输入只需要原子坐标。键只是我们虚构来理解化学的，不需要输入。

也就是说，我在chemdraw里面画的单键，双键都没区别，只要他们的原子坐标是一样的就是一样的？

还有键长，键角是怎样确定的，是画好就可以的，还是要修改啊?
不知怎么改啊。
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4楼2014-07-09 23:06:05
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fujishima

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by oinkmasta at 2014-07-09 22:42:47
同楼上，键在高斯中只是方便你观察分子的，计算方面没有键也可以。
当然，如你要调整构型，还是有键看得清楚。是我的话就直接在高斯里面画分子了，不会花太久的。

高斯里画分子好像很麻烦啊，还有键长，键角怎么确定啊，我要算的是新东西没有相关的数据啊
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5楼2014-07-09 23:07:35
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oinkmasta

金虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
5楼: Originally posted by fujishima at 2014-07-09 10:07:35
高斯里画分子好像很麻烦啊，还有键长，键角怎么确定啊，我要算的是新东西没有相关的数据啊...

用GaussView画应该是非常直观的啊，右键builder就可以选择调整键长／键角／二面角等。不是在高斯的输入文件里画
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16届本科在北美
6楼2014-07-09 23:11:08
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fujishima

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by oinkmasta at 2014-07-09 23:11:08
用GaussView画应该是非常直观的啊，右键builder就可以选择调整键长／键角／二面角等。不是在高斯的输入文件里画...

如果我先用高斯的几何优化计算，然后再算能量，会不会更准确一点
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7楼2014-07-10 00:11:38
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crosschannel

金虫 (正式写手)
★
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掌握好原子间距离就行啦，在高斯里输入原子坐标的时候，你要是想让两原子成键，距离不能太远就好
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8楼2014-07-10 00:58:29
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oinkmasta

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
7楼: Originally posted by fujishima at 2014-07-09 11:11:38
如果我先用高斯的几何优化计算，然后再算能量，会不会更准确一点...

几何优化是指什么？opt吗？（我用的英文版，所以不知道几何优化是不是＝优化＝opt）
如是opt会在summary里面给出能量的。
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16届本科在北美
9楼2014-07-10 02:50:27
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yuliwang

木虫 (正式写手)
★
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我也用Gaussian算过，楼主说的共轭键等，就算你搭建了，结构优化之后也会变掉的，总的来说，共轭键在优化后的结构上是没有明显的单双键之分的，但是计算结果分析时，共轭结构对计算结果有很大的贡献，我马上有一篇文章跟这个有点关系，待审呀！
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10楼2014-07-10 07:49:11
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