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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 序列拼接
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shellyxss

金虫 (正式写手)

[求助] 序列拼接 已有2人参与

我对两条基因测序了，理论上两条序列里面其中一条命名为1)的最后60个碱基应该和另一条（命名为2）的前60个碱基一样，然后就可以拼接上，但是实际上我对1和2先比对了一下，1的最后8个碱基不能和2的序列比对上，而且前面序列相似度也是92%。
请问这两条序列可以拼接嘛？
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Always be curious about nature
1楼 2014-07-06 20:55:45
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
shellyxss: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-07-17 08:30:21
你能看到测序图吗？只保留峰很清晰的序列，如果就算这样也不是100%相同的话，一般是要重新再测的。
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7楼2014-07-17 08:25:24
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匿名

木虫 (小有名气)

小志
★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2014-07-07 08:34:21
本帖仅楼主可见
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2楼2014-07-06 22:07:00
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 安志达天下 at 2014-07-06 22:07:00
一般来说一个序列的两端测序都是不太准确的，你不必纠结与后八个碱基，将第二条序列往前多移几个碱基，相似度高是可以拼接的

相似度高的区域不相似的地方应该怎么拼接呢？
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Always be curious about nature
3楼2014-07-07 09:36:57
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shellyxss

金虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by wizardfan at 2014-07-17 08:25:24
你能看到测序图吗？只保留峰很清晰的序列，如果就算这样也不是100%相同的话，一般是要重新再测的。

谢谢了，我应该重测哪一段序列呢？还是都要重新测？
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Always be curious about nature
8楼2014-07-17 08:30:56
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