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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 基因组提取
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mashuyan13

新虫 (小有名气)

[交流] 基因组提取

求大神指点，我用天根试剂盒提取细菌基因组，提完之后跑琼脂糖凝胶电泳，为什么一条带都没有，但是我直接做16S通用引物的PCR，结果就能p出来，另外，我的菌我不知道是革兰氏阴性还是阳性，我的菌是黑色的，不加溶菌酶，加入蛋白酶K和SDS之后它就直接变得澄清了，是不是它的细胞壁就被破裂开了，是革兰氏阴性菌？
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1楼 2014-07-03 21:23:38
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yuanyeguhong

至尊木虫 (文坛精英)
★
mashuyan13(金币+1): 谢谢参与
闲来逛逛……
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5楼2014-07-03 21:38:20
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aabuzhangjun

新虫 (知名作家)
★
mashuyan13(金币+1): 谢谢参与
祝福，祈福，愿楼主今后一切顺利，愿自己及女朋友工作顺利，祈福！
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6楼2014-07-03 21:58:40
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
可以做革蓝氏染色看看结果；

[ 发自小木虫客户端 ]
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7楼2014-07-03 22:45:20
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by aabuzhangjun at 2014-07-03 21:58:40
祝福，祈福，愿楼主今后一切顺利，愿自己及女朋友工作顺利，祈福！

谢谢，也祝你们幸福
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8楼2014-07-04 09:18:14
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by HYZ221314 at 2014-07-03 22:45:20
可以做革蓝氏染色看看结果；

是，但是我的菌附着在硫化亚铁沉淀上，不知道能不能染上颜色
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9楼2014-07-04 09:19:16
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HYZ221314

至尊木虫 (职业作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by mashuyan13 at 2014-07-04 09:19:16
是，但是我的菌附着在硫化亚铁沉淀上，不知道能不能染上颜色...

那就过滤洗洗嘛，也难怪，你提不出来，估计是固体物影响了
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11楼2014-07-04 09:41:42
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
11楼: Originally posted by HYZ221314 at 2014-07-04 09:41:42
那就过滤洗洗嘛，也难怪，你提不出来，估计是固体物影响了...

下次可以试试
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12楼2014-07-08 18:14:41
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dgm1208

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
16S 一般有点DNA作为模板就可以扩出来，所以说你的dna应该是提出来了，但是提的效果不佳，所以看不到明显的条带，细菌做16S，一般菌落pcr就能做出来···
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13楼2014-07-08 19:04:08
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mashuyan13

新虫 (小有名气)
引用回帖:
13楼: Originally posted by dgm1208 at 2014-07-08 19:04:08
16S 一般有点DNA作为模板就可以扩出来，所以说你的dna应该是提出来了，但是提的效果不佳，所以看不到明显的条带，细菌做16S，一般菌落pcr就能做出来···

那pcr能p出1500bp左右的条带的话，说明我的基因组里有16s的模板这样说对吗？还有就是如果我的菌是革兰氏阳性的话，不加溶菌酶，是不是提不出来基因组呀？
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14楼2014-07-08 20:22:00
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徐风若水

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
如果是阳性不加溶菌酶就不容易提出来的，我的是阳性菌就不好提

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15楼2014-07-09 00:02:49
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SCI-ICS2楼
2014-07-03 21:33   回复  
mashuyan13(金币+1): 谢谢参与
祝福
tzynew3楼
2014-07-03 21:36   回复  
mashuyan13(金币+1): 谢谢参与
阿Q~~4楼
2014-07-03 21:36   回复  
mashuyan13(金币+1): 谢谢参与
mashuyan1310楼
2014-07-04 09:19   回复  
引用回帖:
5楼: Originally posted by yuanyeguhong at 2014-07-03 21:38:20 闲来逛逛……

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