| 查看: 2847 | 回复: 0 | |||
[求助]
急求用MEGA做核酸的ka/ks的方法
|
| 楼主有一批数据，是20个有差异的核苷酸序列，想计算核酸的同义和非同义替换，用MEGA做ka/ks。之前问过一个同学，他说的方法是将同义替换和非同义替换分别计算，然后把比值相除，最后再求平均。但有个问题是：有很多做分母的数值是0，这样除法就没有意义了。可是同学说分母为0的那种结果直接去掉就行了，只把有数据的结果求平均值就能得出这所有序列的ka/ks。但是楼主有个疑问，假如我这20条序列里有5个是一模一样的，那同义替换的值就是0，在最后计算ka/ks的时候岂不是将这些相同序列的值都排除掉了？还是说计算ka/ks时用的序列必须是都不相同的才行？求高手解答，谢谢！如果有具体的贴图就更完美了，追加金币。 |
回复此楼» 猜你喜欢
筑牢营养安全线：以精准检测，护健康基石
已经有0人回复
-
推荐一些20种氨基酸检测的实际应用案例
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有132人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人