| 查看: 2922 | 回复: 0 | ||
[求助]
急求用MEGA做核酸的ka/ks的方法
|
| 楼主有一批数据，是20个有差异的核苷酸序列，想计算核酸的同义和非同义替换，用MEGA做ka/ks。之前问过一个同学，他说的方法是将同义替换和非同义替换分别计算，然后把比值相除，最后再求平均。但有个问题是：有很多做分母的数值是0，这样除法就没有意义了。可是同学说分母为0的那种结果直接去掉就行了，只把有数据的结果求平均值就能得出这所有序列的ka/ks。但是楼主有个疑问，假如我这20条序列里有5个是一模一样的，那同义替换的值就是0，在最后计算ka/ks的时候岂不是将这些相同序列的值都排除掉了？还是说计算ka/ks时用的序列必须是都不相同的才行？求高手解答，谢谢！如果有具体的贴图就更完美了，追加金币。 |
回复此楼» 猜你喜欢
ALK5 高选择性小分子 LY-3200882：可放大合成路线与质控要点解析
已经有0人回复
-
AM630（CAS 164178-33-0）：CB2 选择性配体的实验使用与供应要点
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有80人回复
-
ADC标杆分子T-DM1全解析：从结构设计到实验室应用的技术要点
已经有0人回复
-
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做？
已经有0人回复
-
His标签蛋白纯化怎么才能快？
已经有0人回复
-
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析
已经有0人回复
-
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用
已经有0人回复
-
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点
已经有0人回复
-
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
-
SW033291 科研使用解析：分子特征、储存与实验获取要点
已经有0人回复
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人