应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 想在4倍体棉花里面扩一个基因，用雷蒙德氏棉花（2倍体，已完成测序）设计引物。。
61/1返回列表
查看: 1266  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

volcanozhao

新虫 (初入文坛)

[求助] 想在4倍体棉花里面扩一个基因，用雷蒙德氏棉花（2倍体，已完成测序）设计引物。。 已有1人参与

有很多contig     4倍体棉花里得到的。。比对后挑选了几个候选Gene。。
困惑的 问题 1
           ncbi blast比对时。。分别选择 核酸序列数据库Nucleotide collection和   四倍体棉花est数据库   比对时。。结果为什么不一样？而且没有重复的居然。
问题2
          2倍体雷蒙德氏棉已经测序。。。根据2倍体的CDs和cDNA设计引物。。拿4倍体棉cDNA 作为模板扩增，行不。。？
问题3
         我就是根据2倍体序列设计的。。。可是没有p出来。一周啦。。
         可是有人明明也是这样做就出来啦。。


越来越不相信  基因  PCR 这些东东了。。感觉。。咋这么难。。。唉。。。
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2014-06-27 17:26:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
volcanozhao: 金币+1, ★有帮助 2014-06-28 09:10:36
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-06-28 12:58:01
volcanozhao: 金币+4 2014-06-30 09:24:32
1.Blastn时，nr库与EST库不重，所以结果不一样。
2.现在另一个二倍体亚洲棉的测序也完成了，数据也可以下到，你也可以试下用这个做模板设计引物。
3.PCR的影响因素很多，不出结果也可能是模板或反应体系或程序的问题。
赞一下 回复此楼
2楼2014-06-27 23:54:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

volcanozhao

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-06-27 23:54:42
1.Blastn时，nr库与EST库不重，所以结果不一样。
2.现在另一个二倍体亚洲棉的测序也完成了，数据也可以下到，你也可以试下用这个做模板设计引物。
3.PCR的影响因素很多，不出结果也可能是模板或反应体系或程序的问 ...

谢谢。木棉那个好像还没发表。。没找到。。
赞一下 回复此楼
3楼2014-06-28 09:11:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by volcanozhao at 2014-06-28 09:11:06
谢谢。木棉那个好像还没发表。。没找到。。...

已经发了Genome sequence of the cultivated cotton Gossypium arboreum，这个题目在nature genetics上。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2014-06-28 10:53:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

volcanozhao

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2014-06-28 10:53:09
已经发了Genome sequence of the cultivated cotton Gossypium arboreum，这个题目在nature genetics上。...

前辈，，给个数据库链接吧。。 http://cgp.genomics.org.cn/,文章中给的这个，只有雷蒙德氏的。。谢谢啦
赞一下 回复此楼
5楼2014-06-30 09:24:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by volcanozhao at 2014-06-30 09:24:10
前辈，，给个数据库链接吧。。 http://cgp.genomics.org.cn/,文章中给的这个，只有雷蒙德氏的。。谢谢啦...

原始数据在NCBI上，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/wgs/?val=AYOE01#contigs，BLAST比对时选择tree cotton（taxid：29729）库
赞一下 回复此楼
6楼2014-06-30 11:55:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 volcanozhao 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 310求调剂 +13 666真好 2026-04-11 14/700 2026-04-12 16:48 by 1005715100
[考研] 267求调剂 +8 再忙也要吃饭啊 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:42 by cfdbai
[考研] 271求调剂 +21 2261744733 2026-04-11 21/1050 2026-04-11 20:19 by Angchemist
[考研] 295求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-05 7/350 2026-04-11 19:02 by laoshidan
[考研] 296求调剂 +6 汪！？！ 2026-04-09 6/300 2026-04-11 11:25 by zhq0425
[考研] 283求调剂，工科！ +12 苏打水7777 2026-04-08 12/600 2026-04-11 10:28 by 逆水乘风
[考研] 368求调剂 +3 17385968172 2026-04-10 3/150 2026-04-10 20:12 by 电子奥德彪
[考研] 吉大计算机技术331分，英语六级，求调剂 +3 峰峰021116 2026-04-09 3/150 2026-04-10 20:01 by chemisry
[考研] 265求调剂 +12 风说她早忘了 2026-04-10 13/650 2026-04-10 18:56 by chemisry
[考研] 293调剂 +25 yj1221 2026-04-08 26/1300 2026-04-10 15:02 by 柴小白
[考研] 材料复试求调剂 +20 xhhdjdjsjks 2026-04-09 20/1000 2026-04-10 10:25 by 孙小小12457
[考研] 初试分332，一志愿报考西北工业大学， +11 故人?? 2026-04-09 11/550 2026-04-09 21:54 by JineShine
[考研] 349学科化学045106求调剂，化学类都可以 +8 保好懂懂 2026-04-08 8/400 2026-04-09 14:03 by xulei3024
[考研] 086004 求调剂 309 +7 Yin DY 2026-04-08 7/350 2026-04-09 13:59 by Delta2012
[考研] 招收有机化学、化工，药学，食品灯专业学生 +3 yrfhjgdj 2026-04-08 3/150 2026-04-09 10:15 by QYQX_123
[考研] 327求调剂 +10 Xxjc1107. 2026-04-06 11/550 2026-04-09 01:21 by lature00
[考研] 材料考研求调剂总分280 +30 mkjlz1 2026-04-06 35/1750 2026-04-08 21:25 by cyh—315
[考研] 270求调剂 +3 031127 2026-04-06 4/200 2026-04-08 21:00 by 逆水乘风
[考研] 计算机11408 287 求调剂 +3 LiLe5 2026-04-07 3/150 2026-04-07 23:15 by shanqishi
[考研] （调剂）一志愿报考哈尔滨工业大学0857资源与环境专业378分考生 +7 狠狠加油 2026-04-05 8/400 2026-04-06 16:52 by momo皓
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭