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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 解淀粉芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌区分
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xiaoping1986

银虫 (著名写手)

[求助] 解淀粉芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌区分 已有3人参与

最近鉴定一株菌，发现API和16S结果都是解淀粉芽孢杆菌或枯草芽孢杆菌，然后通过构建系统发育树发现与解淀粉芽孢杆菌关系比较接近，可以说明该菌就是解淀粉芽孢杆菌吗？
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1楼 2014-06-25 23:02:38
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xiaoping1986

银虫 (著名写手)
16S NCBI上比对和解淀粉芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌同源性都是99%
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2楼2014-06-25 23:04:08
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xiaoping1986

银虫 (著名写手)
如果这种方法是科学的，能不能提供相关文献参考下，谢谢！
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3楼2014-06-25 23:07:27
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
扩增一个gyrB基因，然后与模式菌株比对一下，就知道结果啦
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4楼2014-06-25 23:14:36
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wzq_ing

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
学习了，我也在同时做着两个菌，
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5楼2014-06-26 08:03:46
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xiaoping1986

银虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2014-06-25 23:14:36
扩增一个gyrB基因，然后与模式菌株比对一下，就知道结果啦

能不能以发育树确定?
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6楼2014-06-26 09:28:52
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by xiaoping1986 at 2014-06-26 09:28:52
能不能以发育树确定?...

可以用gyrB发育树看，不过你可以直接比对相似性，最直接

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7楼2014-06-26 09:32:40
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xiaoping1986

银虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2014-06-26 09:32:40
可以用gyrB发育树看，不过你可以直接比对相似性，最直接
...

做16S的发育树可以吗？
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8楼2014-06-26 13:25:33
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liuhaolin3

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by xiaoping1986 at 2014-06-26 13:25:33
做16S的发育树可以吗？...

这个要看相似度了!如果很高，结果就不太好确定

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9楼2014-06-27 13:27:21
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硝化细菌

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by liuhaolin3 at 2014-06-27 13:27:21
这个要看相似度了!如果很高，结果就不太好确定
...

做枯草芽孢杆菌的实时荧光定量可以用gyrB基因做出来吗，我根据这个基因设计了好几对引物目前还没扩出来？多谢解答了，谢谢
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10楼2014-10-09 10:30:09
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