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于小歪

铁杆木虫 (正式写手)

[求助] 求助软件,谢谢 已有2人参与

求大神告诉我.fastq数据用什么软件打开处理(带个下载链接,谢谢),还有.stat和.ps,万分感谢
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

★ ★ ★
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-07-30 11:23:55
引用回帖:
3楼: Originally posted by 于小歪 at 2014-06-13 10:16:57
我是蛋白质高通量测序后得到的表达谱,我想通过不同样本的表达谱,比较不同样本的基因表达的差异,你会吗??万分感谢...

听上去可以用cufflink,当然Quality Control这步不可省。
推荐你用usegalaxy.org, 不需要安装软件,唯一不好的地方就是你的数据要上传到别人的服务器上面。
Galaxy在NGS中应用很多,现成的教材也很多
4楼2014-06-13 23:37:39
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
于小歪(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-06-13 16:40:33
fastq看你要做什么了,比如QC,assembly, 格式转换等
2楼2014-06-13 07:39:13
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于小歪

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2014-06-13 07:39:13
fastq看你要做什么了,比如QC,assembly, 格式转换等

我是蛋白质高通量测序后得到的表达谱,我想通过不同样本的表达谱,比较不同样本的基因表达的差异,你会吗??万分感谢
3楼2014-06-13 10:16:57
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于小歪

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wizardfan at 2014-06-13 23:37:39
听上去可以用cufflink,当然Quality Control这步不可省。
推荐你用usegalaxy.org, 不需要安装软件,唯一不好的地方就是你的数据要上传到别人的服务器上面。
Galaxy在NGS中应用很多,现成的教材也很多...

我现在只有测序后的原始数据,你能具体点告诉我一步步怎么做吗?我是真心不会,万分感谢

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-06-13 23:48:59
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