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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 动力学模拟中标准键长数据在立场里还是拓扑文件里读取
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29050801

新虫 (小有名气)

[求助] 动力学模拟中标准键长数据在立场里还是拓扑文件里读取

最近在用NAMD计算一个分子的时候，没有找到对应的结构文件。因此需要手动修改。
从计算公式

来看，应该是要有一个标准键长、键角、二面角的参数
请问这些正常值（比如键长里的r0），是在什么文件里面第一次出现，并且在后续计算中调用的呢？
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1楼 2014-06-08 08:51:15
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