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vmd搭水盒子问题
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我用VMD 搭溶质的水盒子，用的是solvate的命令，但是生成的盒子是长方体而不是正方体，很是疑惑有没有其他命令可以写。求各位帮助。 solvate ubq.psf ubq.pdb -t 5 -o ubq wb，表示生成的盒子，就水而言，它的长度是10埃，但是算上溶质，边长就不能保持一样，因为溶质有大小。 求大神们帮忙，有没有其他命令。。。 |
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