24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 619  |  回复: 2
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yelverxm

金虫 (小有名气)

[交流] [求助]autodock中配体原子类型超过6种不能运行?

向大家请教,我在使用autodock过程中,其中一个配体的原子类型有七种了,然后运行提示原子类型超过6,运行错误。主要那个配体含有F,N,S等多种原子。

在这种情况下,该如何调整设置啊?

谢谢
回复此楼
In God we trust
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjmed

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
suntao1982(金币+3,VIP+0):欢迎长来计算模拟版!
1、编译autodock3/4前,编辑autodock/autocomm.h,修改下面的数值:
        #define MAX_MAPS     14  
        #define ATOM_MAPS    12  
注:
        MAX_MAPS:Maximum number of energy maps.(默认8)
        ATOM_MAPS:Number of atomic affinity grids.(默认6)

2、编译AutoGrid3之前,编辑autogrid/autocomm.h,修改下面的数值:
        #define MAX_MAPS     14  
        #define ATOM_MAPS    12  
注:
        MAX_MAPS:Maximum number of energy maps.(默认8)
        ATOM_MAPS:Number of atomic affinity grids.(默认6)

3、autogrid4的编译,不需要修改。
Timeandtidewaitsfornoman!
3楼2008-04-01 08:04:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

whitewatercn

银虫 (小有名气)

★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):欢迎常来计算模拟版!
修改几行源代码,重新编译一下即可,

详细信息到autodock的主页上去找,或者查查 autodock mailling list. 建议做autodock之前先花几天时间仔细看看上面的内容,别人都碰到什么问题,如何解决的.
2楼2008-03-28 11:34:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专业383求调剂 +6 郭阳阳阳成 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:32 by 无际的草原
[考研] 一志愿中国石油大学化学工程323分求调剂 +4 化工专硕323分 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:12 by dongzh2009
[考研] 材料调剂 +8 一样YWY 2026-04-03 8/400 2026-04-03 21:46 by lbsjt
[考研] 求调剂机会 +5 意染ivy 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:13 by qoooooo614
[考研] 085404总分289,求调剂 +3 Acesczlo 2026-03-29 3/150 2026-04-03 14:41 by 氮气气气
[考研] 0705理学294求调剂 +3 成果成果cg5 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:04 by simons1972
[考研] 275求调剂 +14 waltzh 2026-04-01 14/700 2026-04-03 11:24 by qqq850810
[考研] 08工科275分求调剂 +14 AaAa7420 2026-03-31 14/700 2026-04-03 11:13 by cocolv
[考研] 生物学求调剂 +3 15064154688 2026-04-03 3/150 2026-04-03 10:28 by macy2011
[考研] 一志愿深大085601材料工程专业(专硕)300分可以调剂去哪 +8 10160315 2026-04-02 8/400 2026-04-03 09:36 by hypershenger
[考研] 302求调剂一志愿华中师范大学 +7 小江小江江江 2026-04-02 7/350 2026-04-02 21:48 by macy2011
[论文投稿] chinese chemical letters英文版投稿求助 120+4 Yishengeryi 2026-03-30 6/300 2026-04-02 17:19 by Yishengeryi
[考研] 求调剂,一志愿南京师范大学计算机专硕,初试373,六级通过, +3 计算机追梦人 2026-04-01 3/150 2026-04-02 07:57 by fxue1114
[考研] 一志愿北交大材料工程,总分358 +4 cs0106 2026-04-01 4/200 2026-04-02 07:42 by 尚水阁主
[考研] 086000生物与医药 初试274求调剂 +5 小叮当来了 2026-03-30 6/300 2026-04-01 14:25 by mxj1203
[考研] 085600,321分求调剂 +13 大馋小子 2026-03-31 13/650 2026-04-01 12:35 by chemdavid
[考研] 土木304求调剂 +3 兔突突突, 2026-03-31 3/150 2026-04-01 09:42 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学调剂 +11 景随风 2026-03-29 16/800 2026-03-31 10:14 by herarysara
[考研] 一志愿大连理工大学材料求调剂 +6 Gymno 2026-03-30 6/300 2026-03-31 07:26 by 无际的草原
[考研] 312,生物学求调剂 +3 小译同学abc 2026-03-28 3/150 2026-03-28 15:32 by 落睿可思
信息提示
请填处理意见