24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 618  |  回复: 2
当前主题已经存档。

yelverxm

金虫 (小有名气)

[交流] [求助]autodock中配体原子类型超过6种不能运行?

向大家请教,我在使用autodock过程中,其中一个配体的原子类型有七种了,然后运行提示原子类型超过6,运行错误。主要那个配体含有F,N,S等多种原子。

在这种情况下,该如何调整设置啊?

谢谢
回复此楼
In God we trust
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

whitewatercn

银虫 (小有名气)

★ ★
suntao1982(金币+2,VIP+0):欢迎常来计算模拟版!
修改几行源代码,重新编译一下即可,

详细信息到autodock的主页上去找,或者查查 autodock mailling list. 建议做autodock之前先花几天时间仔细看看上面的内容,别人都碰到什么问题,如何解决的.
2楼2008-03-28 11:34:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wjmed

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
suntao1982(金币+3,VIP+0):欢迎长来计算模拟版!
1、编译autodock3/4前,编辑autodock/autocomm.h,修改下面的数值:
        #define MAX_MAPS     14  
        #define ATOM_MAPS    12  
注:
        MAX_MAPS:Maximum number of energy maps.(默认8)
        ATOM_MAPS:Number of atomic affinity grids.(默认6)

2、编译AutoGrid3之前,编辑autogrid/autocomm.h,修改下面的数值:
        #define MAX_MAPS     14  
        #define ATOM_MAPS    12  
注:
        MAX_MAPS:Maximum number of energy maps.(默认8)
        ATOM_MAPS:Number of atomic affinity grids.(默认6)

3、autogrid4的编译,不需要修改。
Timeandtidewaitsfornoman!
3楼2008-04-01 08:04:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yelverxm 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 调剂 +8 JLLLLLLLLLL 2026-04-03 8/400 2026-04-03 22:06 by 无际的草原
[考研] 材料334求调剂 +9 Eecho# 2026-04-03 9/450 2026-04-03 21:38 by lbsjt
[考研] 315求调剂 +12 小羊小羊_ 2026-04-02 12/600 2026-04-03 18:22 by ls刘帅
[考研] 0854求调剂 +3 assdll 2026-04-03 3/150 2026-04-03 14:32 by fxue1114
[考研] 生物学求调剂 +3 15064154688 2026-04-03 3/150 2026-04-03 10:28 by macy2011
[考研] 调剂 +7 祉岷. 2026-04-02 7/350 2026-04-03 09:11 by 花呗还欠600
[考研] 322求调剂:一志愿湖南大学 材料与化工(085600),已过六级。 +12 XX小邓 2026-03-29 13/650 2026-04-02 21:39 by 百灵童888
[考研] 土木304求调剂 +4 兔突突突, 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:16 by 兔突突突,
[考研] 349求调剂 +10 zwjjjjjj 2026-03-31 10/500 2026-04-02 20:13 by dongzh2009
[考研] 264分,求任意工科调剂 +4 zzlqwq 2026-03-29 5/250 2026-04-02 17:17 by 何曾几何
[考博] 材料工程专业硕士申博 +3 麟正宇 2026-03-30 3/150 2026-04-02 15:04 by greychen00
[考研] 283求调剂 +3 jiouuu 2026-04-02 4/200 2026-04-02 14:08 by 哒哒哒呱呱呱
[考研] 085600 一志愿9 总分351 求调剂学校 +7 czhcz 2026-03-31 9/450 2026-04-01 19:24 by 无际的草原
[考研] 环境工程调剂 +9 hyzzzzzzz. 2026-04-01 9/450 2026-04-01 14:20 by salamander`
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-03-31 11/550 2026-04-01 11:35 by wangjy2002
[考研] 求0861交通运输专硕or材料专硕调剂 +4 勒布朗@ 2026-03-31 4/200 2026-04-01 09:54 by 一只好果子?
[考研] 一志愿华东师范大学有机化学专业,初试351分,复试被刷求调剂! +9 真名有冰 2026-03-29 10/500 2026-03-31 18:01 by xhai2011
[考研] 本2一志愿C9-333分,材料科学与工程,求调剂 +9 升升不降 2026-03-31 9/450 2026-03-31 18:01 by 无际的草原
[基金申请] 面上5B能上会吗? +8 redcom 2026-03-29 8/400 2026-03-31 15:53 by niuailing
[考研] 279求调剂 +12 j的立方 2026-03-29 12/600 2026-03-30 20:30 by dick_runner
信息提示
请填处理意见