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yelverxm金虫 (小有名气)
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[交流]
[求助]autodock中配体原子类型超过6种不能运行？
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向大家请教，我在使用autodock过程中，其中一个配体的原子类型有七种了，然后运行提示原子类型超过6，运行错误。主要那个配体含有F，N，S等多种原子。 在这种情况下，该如何调整设置啊？ 谢谢 |
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whitewatercn
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
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- 红花: 2
- 帖子: 245
- 在线: 10.3小时
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- 性别: GG
- 专业: 化学信息学、药物设计
2楼2008-03-28 11:34:42
wjmed
木虫 (正式写手)
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- 专业: 化学生物学与生物有机化学
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suntao1982(金币+3,VIP+0):欢迎长来计算模拟版!
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1、编译autodock3/4前，编辑autodock/autocomm.h，修改下面的数值： #define MAX_MAPS 14 #define ATOM_MAPS 12 注： MAX_MAPS：Maximum number of energy maps.（默认8） ATOM_MAPS：Number of atomic affinity grids.（默认6） 2、编译AutoGrid3之前，编辑autogrid/autocomm.h，修改下面的数值： #define MAX_MAPS 14 #define ATOM_MAPS 12 注： MAX_MAPS：Maximum number of energy maps.（默认8） ATOM_MAPS：Number of atomic affinity grids.（默认6） 3、autogrid4的编译，不需要修改。 |
3楼2008-04-01 08:04:03