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yelverxm金虫 (小有名气)
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[交流]
[求助]autodock中配体原子类型超过6种不能运行?
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向大家请教,我在使用autodock过程中,其中一个配体的原子类型有七种了,然后运行提示原子类型超过6,运行错误。主要那个配体含有F,N,S等多种原子。 在这种情况下,该如何调整设置啊? 谢谢 |
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whitewatercn
银虫 (小有名气)
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2楼2008-03-28 11:34:42
wjmed
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- 专业: 化学生物学与生物有机化学
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suntao1982(金币+3,VIP+0):欢迎长来计算模拟版!
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1、编译autodock3/4前,编辑autodock/autocomm.h,修改下面的数值: #define MAX_MAPS 14 #define ATOM_MAPS 12 注: MAX_MAPS:Maximum number of energy maps.(默认8) ATOM_MAPS:Number of atomic affinity grids.(默认6) 2、编译AutoGrid3之前,编辑autogrid/autocomm.h,修改下面的数值: #define MAX_MAPS 14 #define ATOM_MAPS 12 注: MAX_MAPS:Maximum number of energy maps.(默认8) ATOM_MAPS:Number of atomic affinity grids.(默认6) 3、autogrid4的编译,不需要修改。 |

3楼2008-04-01 08:04:03











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