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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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jwing

金虫 (初入文坛)

[交流] 求助:关于π—π堆积作用

请教π—π堆积作用一般怎样察看,用什么软件看最好。
具体要看些什么参数呢?
谢谢!!
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

呵呵  也不大清楚  应该和距离以及重叠的面积有关吧  呵呵
2楼2008-03-20 19:23:13
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jwing

金虫 (初入文坛)

能不能说的具体点呢!!谢谢各位了!!
3楼2008-03-20 20:36:14
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douxiaoyang2007

有一片晶体生长于设计的文献,谈到这个问题,回头找一下传上去。
4楼2008-03-21 08:03:17
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biyanfeng

铜虫 (著名写手)

你有PLATON软件吗?
如果有的话
你用PLATON打开的你的修改好的CIF文件(最好是CIF,别的也可以,如INS,RES)
在菜单PUB---CAL运算,得到*.LIS文件(注意不是XP生成的*.LST),在文件的中间有对不同的环的定义,接着下面给了所定义的所有环的面到心,心到心,边到面和点到面(C-H。。π)的距离以及角度等,挑选心到心距离小于4.0的(当然还要看二面角的大小,距离越小,二面角越小,作用越强。然后借助象MERCURY这样的软件看看你挑选出的作用是否是你想要的(一般想要的是分子间的,分子内的想对于配位作用就不值得提)
最后就用DIMOND做了,找到面插入假原子(插一个,别的对称长出来),连接假原子,编辑一下就得到想要的键了
再具体的就太具体了
5楼2008-03-21 08:56:53
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biyanfeng

铜虫 (著名写手)

同样方法也能找到氢键和做氢键,呵呵
做成一个,别的都好说了
6楼2008-03-21 08:57:54
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huahua1216

至尊木虫 (文坛精英)

高手  呵呵
7楼2008-03-21 15:52:43
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shengershao

银虫 (正式写手)

其实XP就可以做了
用mpln命令可以找到面和面的距离,以及中心距离,基本上这两个就决定了堆积的强度
8楼2008-03-21 20:34:58
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cleanice

金虫 (小有名气)

谢谢啊,受益匪浅
9楼2008-04-06 21:59:33
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