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jinzhan991金虫 (小有名气)
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DGGE中用条带亮度不能代表菌株是否是优势菌吗？生物侠们来瞅瞅~ 已有1人参与
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各位生物大侠： 本人做工程的，用了DGGE表征自己系统的微生物结构，对比两样品，同位置不同亮度来说明该菌在整个群落里是衰弱了还是占优势了。论文投出后，一专家认为我的DGGE说明有问题，原话如下“the use of the brightest band sequences to identify the main populations does not guarantee a proper description of the communities.” 实在是不太懂，如果不能这么说明，要这么解释类  ？多谢多谢！ |
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jinzhan991
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5楼2014-05-30 23:26:35
grase 
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2楼2014-05-30 11:03:37
liuchi0426
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【答案】应助回帖
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jinzhan991(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-06-03 09:46:18
jinzhan991: 金币+10, ★★★很有帮助, 久等了 我最近在学quangtity one 2014-06-11 09:10:26
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| 审稿人一针见血的指出了你的问题，DGGE的条带亮度是要用quantity one 软件转换后进行计算的，你只是说那个亮那个不亮，没有数据支持肯定不行的，就像统计里的p值和power一样都有要求的，所以你要给出个显著性检验才对，我们这些做群落高通量测序的，对这个特敏感 |
3楼2014-05-30 22:52:24
jinzhan991
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4楼2014-05-30 23:23:18