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用MS 建模生成的 材料表面模型 如何导入到 gromacs ？ 已有1人参与
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各位大侠： 第一次在小木虫上发帖求助。如题。 已用MS 建模生成的 材料表面模型 ，希望放到gromacs中 计算 蛋白质-材料表面相互作用。 我试着将 模型 保存为 pdb格式。但是，当用vmd 打开pdb时，发现很多bond连接是错误的，与MS中所显示的有很大差异。 于是，又在MS中保存为 mol2 格式。这下用vmd 打开，显示是没有问题了。 可是，如何才能 将其转变为 gro 格式呐？ 或者提供其他的办法，使得gromacs 可以识别 。 |
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2楼2014-05-30 13:46:26
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
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6楼2019-03-19 22:24:41